外泌體是胞內多泡體與細胞膜融合後，釋放到細胞外的膜性小囊泡，是細胞間訊號傳輸的載體。2013年，諾貝爾生理學或醫學獎授予了三位科學家，表彰其在細胞間囊泡運輸調控機制領域作出突出貢獻，將外泌體研究的熱度推向高潮。近幾年外泌體成為科研熱點，相關論文發表數量呈爆炸式增長。

也許很多老師苦於外泌體研究如此火爆卻無從介入

其實，外泌體就是一種特殊的研究物件，幾乎所有生物研究領域，都可以全新的視角從外泌體角度深入挖掘，給自己的研究錦上添花！幫大家盤一盤外泌體資料庫，看看您是不是可以從這些資料庫中找到一些靈感和研究基礎。

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ExoCarta資料庫（http://www.exocarta.org/）

ExoCarta是首個外泌體標誌物綜合資料庫，由小恩家首席科學家Simpson教授團隊建立，是一個開放的資料庫平臺，收錄了包括人、大鼠、小鼠、綿羊、豚鼠、果蠅、馬、穴兔、牛在內的幾個物種共286個研究結果；涉及到不同組織器官來源的外泌體蛋白，mRNA，miRNA，脂類等資訊。ExoCarta資料庫的典型特點就是具有外泌體蛋白動態的蛋白與蛋白之間相互關係網以及生物學通路。使用者可以從大量的研究中下載最常用的蛋白資料。下載的檔案可直接匯入FunRich工具，進行其他的功能富集和相互關係網分析。該資料庫已經被超過16000名獨立研究人員使用。

2

exoRBase（http://www.exorbase.org/）

exoRBase是人類血液外泌體長鏈RNA-seq資料庫，同時也包括已發表文獻的實驗驗證。該資料庫目前共收錄92例血液樣本，58330個circRNA、15501個LncRNA和18333個mRNA，並提供了註釋、表達水平和可能的來源組織。exoRBase主要特點是對標準化RNA-seq資料的RNA表達譜進行了整合和視覺化。資料涵蓋了健康對照者32例，冠狀動脈心臟疾病（CHD）6例，結腸癌（CRC）12例，肝細胞癌（HCC）21例，胰腺腺癌（PAAD）14例，乳腺癌2例。

3

EVmiRNA（http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVmiRNA）

EVmiRNA，顧名思義，一種細胞外囊泡（EVs）的miRNA資料庫，收錄了17種器官或疾病462個EVs小RNA測序樣本miRNA表達譜。該資料庫提供了3種功能性模組：(i) miRNA表達情況及EVs來源樣本資訊（如血液，乳汁等）；(ii)不同EVs種特異表達的miRNA，便於biomarker篩選研究；(iii)miRNA註釋資訊包括EVs中miRNA表達情況，TCGA癌症型別，miRNA調控通路以及miRNA功能及相關文獻，為細胞外囊泡的miRNA研究提供重要資源。

4

EV-TRACK（http://www.evtrack.org/）

EV-TRACK是以Thery為首的EV-TRACK聯盟建立的EVs研究透明報告線上資料庫，其中包含了EVs相關文獻的方法學引數，基於MISEV（EVs研究最小實驗要求）評估EVs分離及鑑定相關引數。該資料庫的建立旨在規範EVs研究，便於將實驗規範應用於實際研究中，對實驗結果進行解釋和重複。

5

EVpedia （http://evpedia.info）

EVpedia是一個原核和真核生物EVs的高通量資料綜合資料庫，該資料庫提供原核生物、非哺乳類真核生物和哺乳動物囊泡組分（蛋白質、mRNA、miRNA、脂質）的高通量分析資料。除此之外，該資料庫還提供了一系列分析工具，可用於檢索和瀏覽囊泡成分、Gene Ontology富集分析、囊泡蛋白和mRNA的網路分析，以及透過直接同源鑑別比較囊泡資料。同時，該資料庫中還列出EVs研究的相關文獻。這個免費的資料庫可以作為EVs研究進展的一個基本資料庫，有助於闡明這些複雜胞外囊泡的新功能。

6

Vesiclepedia（http://www.microvesicles.org/）

Vesiclepedia是一個EVs分子資料（脂質、RNA和蛋白質）的手工檢索資料庫，收錄了41個物種的1254個獨立研究，349988個蛋白，27646個mRNA，10520個miRNA、639個脂質條目，還可以根據物種、囊泡、分子和樣品型別瀏覽和檢索。

該資料庫是公開的，允許使用者根據不同的搜尋標準查詢和下載EV cargo、 EV分離和表徵模式，生物物理和分子特性以及EV-METRIC，幫助生物醫學科學家評估EV製劑的質量，獲得的相應資料。此外，基於FunRich的Vesiclepedia外掛可以幫助使用者進行資料分析。

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EMBL-EBI外泌體資料庫（http://www.ebi.ac.uk/GOA/exosome）

EMBL-EBI外泌體資料庫是一款針對人類外泌體蛋白GO功能分析的綜合註釋資料庫。該資料庫與實驗室研究人員（Dr S Mathivanan - La Trobe Institute, Dr A Kalea - UCL）及外泌體資料庫Exocarta (http://www.exocarta.org/) 和Vesiclepedia緊密合作，識別用於聚焦註釋的靶蛋白以及外泌體實驗方法學的註釋。

8

Urinary Exosome Protein Database （https://hpcwebapps.cit.nih.gov/ESBL/Database/Exosome/）

本文來自：科研小助手整理自幫研網、生物醫學科研之家