《孫子·謀攻》有句名言“知己知彼，百戰不殆。”SCI論文寫好後也要遵循這個規律，首先要了解自己的SCI論文屬於哪種型別，以便確定投稿哪家國際期刊。
一般SCI的型別主要有以下幾種：
Research Articles(研究性論文)Research Articles是指對理論或基礎研究有貢獻的論文。這種論文可以從研究內容的角度分類，分為純基礎研究和應用性基礎研究兩大類。Research Articles應提供研究工作中收集的重要新資訊，報告新穎且精心設計的研究，並提出完整的研究成果。Research Articles的研究結論不應基於未發表的工作或初步的資料摘要。
作為完整的Research Articles，論文涉及到以前的研究或先例應被瞭解清楚，完整地引用。需要注意的是，純基礎研究可能沒有涉及到科技秘密的問題，但應用性基礎研究雖然只屬於基礎研究，但是涉及到一個新的理論，一個技術突破，或者一個重大發明，可能在某些當前的理論研究中涉及到一些敏感的課題。因此，在向國際期刊提交這種性質的論文時，研究成果是否合適公開發表必須考慮。
Research Articles篇幅較長，例如有SCI期刊規定這種型別論文要有：250 words abstract，包括含義說明、簡潔的單句摘要，可將整體的研究發現和/或結論提煉為更廣大的普通科學工作者快速瞭解;5,000–6,000 words of text;50 references;7 figures and/or tables;其他要求，如10 x 7.5英寸的載玻片概圖，400dpi以上的插圖等等。
Research Articles是我們主要撰寫的論文型別。
Rapid Communication(快訊)Rapid Communication是一般具有重大價值影響力大的簡短文章，其研究表明其有異常價值和影響的意義、及時性或新穎性。如果作者手頭上有時效性很強的研究結果，但來不及完善成Research Article，又很想趕緊發表，那麼整理成Communications，可以投稿試一試。
Research Articles篇幅較短，例如有SCI期刊規定這種型別論文要有：150 word abstract;5,000–2500 words of text;20 references;3 figures and/or tables;其他要求。
Review article(綜述)Review article即“綜述”，不涵蓋原始研究，而是將針對特定主題的許多不同文章的結果，積累成對該領域最新技術的連貫敘述。Review article由在特定領域具有專長的科研人員，在對某科技研究領域的文獻進行廣泛透過大量的閱讀和理解的積累，對該領域研究成果的綜合和思考後，完成文獻的整理和提取。
Review article並非一般的“背景描述”，需要對該領域研究成果的思考。並不是所有的Review article都是想寫就能寫的，一般Review article作者都是學術領頭人(權威專家)。不請自來的Review article作者會被要求投稿前，先將投稿建議書發到期刊編輯部，同意投稿後才能動手寫Review article去投稿。SCI期刊一般採用邀稿形式，由編輯委員會邀請各個行業大牛撰寫，可以促進學科研究的進一步進展。
完整型的Review article一般篇幅較長，要求參考檔案比較多，例如有SCI期刊規定這種型別論文要有：250 word abstract;6,000-7,000words of text;75 references;7 figures and/or tables;其他要求。
對應於完整型的Review article，還有一種迷你型Review article，篇幅較短，例如有SCI期刊規定這種型別論文要有：250 word abstract;2,500-3,000words of text;50 references;4 figures and/or tables;其他要求。
Perspectives article(觀點)Perspectives article為當前關注的主題提供了一種觀點，旨在激發從事科研工作的讀者感興趣的主題的思想。它們很短而且很關鍵。
Research Articles篇幅較短，例如有SCI期刊規定這種型別論文要有：200 word abstract;1,200–1,500 words of text;25 references;3 figures and/or tables;其他要求。
Letters to the Editor(致編輯的信)Letters to the Editor是讀者針對某篇感興趣的論文寫的讀後感。一般由期刊邀請讀者來信(有時效性)，並將由總編輯審閱。如果發現符合該雜誌的出版標準(有關廣泛主題的重要意義和興趣的評論，適合內容的篇幅)，則該來信可傳送給原始文章的作者，並可能傳送給其他作者感興趣的各方與Letters to the Editor在同一期雜誌上發表。
Hypothesis articleHypothesis article即假說類文章，這類的文章往往入門容易，寫好很難。恩格斯曾說過“只要自然科學在思維著，它的發展形式就是假說”，魏格納的大陸漂移假說和愛因斯坦的《相對論》都是著名的科學假說。
如果作者目前手頭沒有像樣的研究資料和結果，“不做實驗寫文章”的論文就這種型別。但是Hypothesis article的寫作要求很高。除了要求高水平的假設能力外，對大量的資料閱讀整理能力和歸納提取能力的要求也是極高的。
Letters(通訊)Letters(也稱為通訊，不要與Letters to the Editor混淆)是對當前重要研究成果的簡短描述，通常被有關科研人員快速跟蹤以立即撰寫發表，因為它們被認為是緊急的，具備很高的現勢性。
Research notes(研究筆記)Research notes是對當前研究結果的簡短描述，被認為比Letters更為緊迫或重要。Research notes一般是焦點研究。
Supplemental articles(補充論文)Supplemental articles是補充論文，通常包含大量的表格資料。這些資料是當前研究的結果，可能是數十頁或數百頁的資料，其中大部分是數值資料。現在，某些期刊僅以線上電子資料方式在Internet上釋出此資料。
Other articles有時候期刊還會刊出一些比較少見的文章型別，如Meeting Abstracts(會議摘要)，Editorial Material(編輯材料)， Monograph chapter(專題論文)，Monograph review(專題綜述)，Report chapter(專題報告)，Report review(綜述報告)等等。
另外，醫學專業的SCI論文還有幾種重要的型別。例如：
Case Series(病例系列報道)Case Series主要描述一群相同診斷的病人或經歷過相同治療的患者的某一段時間的醫學經歷，包括主要子型別為Case Report，還有Cross-Sectional Studies, Surveillance Studies, Ecological Correlational Studies等。
因為Case Series不是隨機對照設計(RCT)，所以它與其他描述性研究一樣，不能用於證明一項臨床治療有效還是無效。描述性研究Case Series有很多用處，包括改進疾病診斷，分析結果趨勢，分析藥物經濟，登錄檔資料結果，尋找可能病因線索等。
因此，看到Case Series的文章，只是給出了一個可能性，並不是結論，需要其他的設計的實驗(RCT)來證明。Case Series行文短小精悍、言簡意賅。
(1)前言：通常用1-2句話簡要說明為什麼要報告該病例;
(2)病例摘要：是個案報告的主要部分，為經過加工整理的病例摘要：包括病例來源，時間，發病情況，臨床特點，患者的特異性表現，特徵性的症狀、體徵及檢查結果，必要時可增加病例或影像學圖片、形態學照片，但應避免能分辨患者體貌特徵的照片(隱私權)，本院或外院的診斷、治療經過，以及資料的結果。
(3)討論：是病例介紹的一個延伸(帶有一定邏輯推理性)，簡單介紹疾病的背景(尤其是罕見病)。應突出罕見病的特色，著重討論診斷、鑑別診斷和確認該病的依據、本病例的新特點和新發現。如要報告資料方面，則著重總結成功治癒的經驗或失敗的教訓，提醒臨床醫生注意有意義但易忽略的問題;如希望說明誤診方面的問題，則應著重分析誤診的原因。
Case Report以罕見或有特殊意義的臨床資料為主;診斷標準應描述準確。切忌照搬原始病例，避免使用各種非客觀性、推測性的語句。
Case Series的文章一般會列舉類似的臨床病例。例數不定，少者4-10例，多者數百例。
Meta-Analysis(薈萃分析)所謂Meta-Analysis是指對研究的研究，可以翻譯為元分析、後設分析、整合分析、薈萃分析等。一項研究只能得出有限的結論，時間、地點、資料、方法，其中任何一項不同都可能引起結論的不同。
Meta-analysis即把所有這些發表出來的研究進行整合、量化、比較、統計分析等，以得出更精確的結論，深入探究某事物或現象的全貌和本質。Meta-Analysis涉及對文獻的收集和整合，因此它屬於文獻回顧的一種;與普通文獻回顧不同的是，它對過去的研究進行評估和判定。
也就是說Meta-Analysis照道理一般難度應比Review大，因為需要進行研究論證。其實當初Meta-Analysis的出現是為了解決各種學術爭端，如果所有的研究者都指向一個結果，那Meta-Analysis存在的必要就沒了。當然，目前學術界對Meta-Analysis的功能有一些爭議，有國內學術文獻機構直接把Meta-Analysis歸為Review article。