在海洋覆蓋地球70％以上，所以這是他們看似堅不可摧的深度已經提供了一系列引人入勝的謎團，從失蹤船隻陰森恐怖的怪物一點也不奇怪。以下是深層的六個謎團，其中一些科學家認為至少已經部分解釋了這些謎團，而其他一些謎團仍然令人費解。
瑪麗·塞萊斯特（MARY CELESTE）1872年12月5日，英國船隻Dei Gratia的船員發現了一艘在亞速爾群島海岸約400英里外浮動的船隻。他們向瑪麗·塞萊斯特（Mary Celeste）求助，但登船後震驚地發現它完全無人駕駛。機組人員消失得無影無蹤，他們的行李仍被存放在他們的宿舍，六個月的食物和飲料沒有被觸碰，而寶貴的工業酒精貨物仍然大部分存在。唯一的線索是船艙中有三英尺半的水，一艘失蹤的救生艇和一臺拆卸的泵。關於船員發生了什麼以及他們為什麼拋棄了一艘看似海上航行的船隻，這是一個持久的謎團的開始。
提出了許多理論，包括犯罪作家亞瑟·柯南·道爾（Arthur Conan Doyle），他在1884年寫下了一個短篇小說，暗示該船員已淪為受害者的報復意圖。更近的理論指出，在波濤洶湧的大海和破碎泵的手指，稱他們被迫隊長髮出命令棄船。由於從未找到失蹤人員，因此似乎不可能有一個令人滿意的答案。
與那國紀念碑與那國紀念碑上被稱為孿生巨石的區域
1986年，一位潛水員在尋找日本琉球群島沿岸觀賞錘頭鯊的好地方時，遇到了一種非同尋常的水下景觀。據報道，該地區看起來像一個古老的淹沒村莊，臺階，孔洞和三角形似乎刻在岩石上。自首次發現以來，就一直圍繞著這個被稱為“與那國紀念碑”的地點進行爭議，一些研究人員，例如海洋地質學家木村昌昭（Masaaki Kimura）—認為這是一個明顯的人造環境，也許是一座擁有數千年曆史的城市，並沉沒在困擾該地區的一場地震中。其他人則認為這是一種自然地質現象，反映出具有構造活動性的地區的砂岩地層（層）。該區域對潛水員開放，因此真正好奇的人可以繫緊儲氣罐並自行決定。
百慕大三角百慕大三角可能比任何其他海洋奧秘都產生了更多的野性理論，專欄文章和線上討論，據說那裡有50多艘船和20架飛機消失了。儘管從未正式定義該三角形，但從某些角度來看，它至少覆蓋了500,000平方英里，位於百慕大，佛羅里達和波多黎各之間。1945年12月，由五名美國海軍TBM復仇者魚雷轟炸機及其14名機組人員組成的19班航班在該地區的例行訓練中失蹤，一無所獲。後來又有報道稱，派出一架搜尋失蹤人員的搜尋救援飛機也失蹤了，引起了人們的極大興趣。查爾斯·貝立茲（Charles Berlitz）的《百慕大三角》（The Bermuda Triangle）等文章和書籍於1974年首次出版，此後以30種語言售出了2000萬冊，這些謎團一直活著，提供了自然和超自然的潛在理論。科學家以及倫敦勞埃德（Lloyd's）的世界知名保險公司都試圖進行揭穿 百慕大三角的神話，這提供了證據，證明在這個繁忙的三角地帶中消失的速度並不比其他類似的航道高，但這就是一個好故事的力量，這是一個故事，似乎很可能會繼續使人著迷。
海妖1907年在倫敦自然歷史博物館展出的巨型魷魚模型
數百年來，水手們講述了一個巨大的海洋生物的傳說，它的巨大觸角被稱為海妖。關於神話般的海妖的故事始於12世紀的斯堪的納維亞半島，1555年，瑞典制圖師奧勞斯·馬格努斯（Olaus Magnus）提供了一個海洋生物的描述，其中“鋒利而長的角圍繞著，就像樹根紮根一樣：十個或十二肘長，非常黑，並且有大眼睛。” 這些故事持續存在，經常提到一個像島一樣大的生物。丹麥歷史學家埃裡克·路德維格森·蓬託皮丹（Erik Ludvigsen Pontoppidan）在其1755年出版的《挪威自然史》中將海妖描述為“無可爭議的世界上最大的海怪”。
科學家們提出這些故事可能源於對巨型魷魚（Archituthis dux）的目擊，儘管也發現了更大，但極其難以捉摸的巨型魷魚（Mesonychoteuthis hamiltoni）的證據。巨大的魷魚被發現在南極洲南部海洋的最深部分，據信最長可達46英尺，重1100磅。問題是這種動物非常稀有，幾乎沒有發現完整的標本，也沒有觀察到活體標本，這意味著很難估計其確切大小。研究人員還注意到，觀察到抹香鯨有大疤痕，並建議這可能是巨大烏賊劇烈相遇的結果。眾所周知，烏賊觸手末端有尖銳的旋轉鉤子。
皇家商人的寶藏皇家商人的遺骸被譽為有史以來最富有的沉船之一。這艘船於1641年從新世界起航，滿載100,000磅黃金，400根墨西哥銀條和數千種珍貴寶石，總價值今天達到13億美元。該船陷入風暴之中，被認為在英格蘭康沃爾海岸附近某處墜落。失事的沉船由於其貨物的巨大價值而被稱為“海洋的多拉多”，多年來，許多尋寶者一直毫無結果地尋找其最後的安息之地，至今仍未被發現。在2019漁民鉤住什麼被認為是錨從商家皇家，但迄今為止，人們認為沉船所處的危險條件和極端深度意味著它尚未得到保護。
海泡沫襲擊2011年12月，英格蘭克利夫斯（Cleveleys）的居民醒來，那似乎是柔軟的積雪。但是噹噹地人冒險走上街頭時，很快就知道這不是暴風雪，而是更加令人困惑的事情。樹木，汽車，道路和房屋都被包裹在白色厚實的泡沫中。可以理解的是，居民很擔心這種奇怪的多環物質的起源，擔心這種物質是由汙染物引起的，因此迅速部署了環境署來採集海泡的樣品。
這座充滿泡沫的小鎮的戲劇性影像很快使記者蜂擁而至，對該地區進行了調查，但泡沫一消失就消失了，只留下了鹹味的殘留物。分析泡沫的科學家證實，它不是由清潔劑引起的，而是懷疑它是由海藻在海中分解和強風的罕見結合所引起的，後者將粘性泡沫打碎並吹入陸地。這種現象顯然是在此之前和之後的其他時間發生的，研究人員現在正在努力嘗試並理解導致這種現象形成的特殊條件，以便在設定另一個厚毯子下降時可以警告居民。
額外獎勵：THE BLOOP-解開謎團多年來，海洋產生了許多令人毛骨悚然的聲音，而且常常是無法解釋的聲音。1997年，來自NOAA的研究人員使用水聽器（水下傳聲器）收聽水下火山活動，發現太平洋中產生了一系列非常響亮而有力的噪音。不尋常的嗡嗡聲使研究人員興奮不已，他們很快以其獨特的聲音將其命名為“ The Bloop”。
關於bloop的起源的理論很多，包括秘密軍事設施，艦船引擎的迴響或巨大的海洋生物。最奇特的建議來自HP Lovecraft的粉絲，他們注意到噪音來自南美附近的一個科幻小說家虛構的沉沒城市裡耶（R'lyeh）。他們提出，這個問題可能源於Lovecraft的“死而有夢”海洋生物克蘇魯。然而，在2005年，科學家發現神秘的聲音實際上是地震（或從冰川上割下的冰山）發出的聲音。