Pfizer/BioNtech 的兩種mRNA疫苗BNT162b1和BNT162b2分別沿著兩條不同的技術路線開發。BNT162b1的mRNA編碼的是新冠病毒刺突蛋白Spike S2受體結合區域(receptor domain)的部分蛋白，也是中和抗體的結合區域。這個區域比較小，為了增加抗原的免疫原性(immunogenecity)，研發者採取了3聚體(3價)的形式。而這個三聚體是透過T4 纖維蛋白摺疊體(T4 fibritin foldon，來源於T4噬菌體)來形成一個穩定的類似三角形的3價受體結構域。

這個設計有一個前瞻性好處：如果新冠病毒的突變很小（假設目前流行A株病毒），現有疫苗產生的中和抗體完全能起作用，那麼三聚體可以完全設計為3A。如果出現的新的變異株B導致現有疫苗產生的中和抗體不起作用，三聚體可以設計為2A+1B。如果還出現了變異株C，三聚體可以設計為1A+1B+1C。這個三異聚體形式的三價疫苗就可以同時對付流行的3個變異毒株。

BNT162b2的mRNA編碼的是整個刺突蛋白，由於這個蛋白比較大，翻譯成蛋白的時候要形成穩定的天然摺疊空間構象，需要將其中兩個氨基酸改為脯氨酸(proline)。

很顯然這是一款單價疫苗，這也是復星醫藥參與BioNtech研製的那一款。