現代科學研究發現，在史前大洪水之前，地球上或許存在著一片大陸，這片大陸具備高度發達的文明。但在一次全球性的災難中，這片大陸沉沒於大西洋，引發巨大災難的是大規模的地震、火山噴發以及之後產生的海嘯。火山會導致整個地中海地區都處於黑暗之中。遠在英國的植物也受到影響，地震威力相當於轟炸廣島的原子彈爆炸威力的4000倍。這片大陸上的史前文明就亞特蘭蒂斯文明。
關於他最早的描述，出現於古希臘哲學家柏拉圖的著作對話錄中。其中描述亞特蘭蒂斯位於歐洲到直布羅陀海峽附近的大西洋之島。是傳說中擁有高度文明發展的古老大陸。在梵蒂岡城國儲存的古代墨西哥著名抄本和存留至今的墨西哥的印第安文明的作品中也有過類似的敘述。其中提到地球上曾先後出現過四代人類。第一代人類有三隻眼，他們並非這裡的居民，而是來自天上。他們毀滅於飢餓，第二代人類毀滅於巨大的火災，第三代人類就是猿人，他們毀滅於自相殘殺。後來又出現了第四代人類，他們毀滅於巨浪滔天的大洪災。一開始，科學家們都以為這不過是無法證實的故事，直到一個世紀之後，考古學家們在大西洋底找到了這個史前文明遺蹟，似乎證實了地球曾經存在過這個文明。
1977年4月，科學家在大西洋與加勒比海交界的百慕大三角區海底發現了一座高達200米的海底金字塔，到了第二年，國際潛水中心主任羅歇韋熱爾率領隊員專程來到百慕大三角海域考察，那天萬里晴空，風平浪靜。正當他們駕著船穩穩地航行在這片海域時，突然起了風暴。海面瞬間迷霧茫茫，白光直射天空，船已無法控制。他們只好捨身潛入海里，當潛到100米深處時，他們看到了一個巨大的金字塔。他有兩個大洞，海水以極快的速度從洞中穿過，激起驚濤駭浪，不一會，當這一現象消失後。海面又恢復了平靜。
為了搞清楚水下金字塔的情況，美國和法國的科學家組織了一個實力雄厚的調查隊，動用先進裝置再次前往百慕大三角海域調查。經仔細測定，他們發現這個坐落在大西洋底的金字塔，與之前在他東面發現的那座金字塔一樣，高200米，邊長300米。建築年代約比埃及大金字塔早7000年。由於海水太深，環境複雜，水下勘察的科學家無法斷定該金字塔與大西洋底的其他古建築物是否是同一時代的產物，這兩座海底金字塔都比大金字塔還要高大，且年代久遠。在金字塔的四周是平坦的海底，沒有火山噴發過的痕跡，也沒有海底山脈從中橫過。
於是有學者猜測這兩座海底金字塔可能是原本建造在陸地上的。後來因發生強烈地震，隨著陸地沉入海底了。也有些學者猜測或許這些海底金字塔就是亞特蘭蒂斯人建造的。本來這還只是猜測，直到美國探險家諾維克拍攝到一張滿是漩渦狀白光影像的照片。於是越來越多的人懷疑海底金字塔是亞特蘭蒂斯人專門保護聖地的一種能量場。他和大金字塔一樣，能吸收和聚集宇宙射線，磁性振盪或其他未知能量波，其內部結構是一個微波諧振腔體，對放射性物質及其他能源有聚集作用。
2012年3月29日一個由多國科學家共同組成的調查組對這兩座海底金字塔重新進行了秘密調查，聲納和水中攝影機顯示這兩個金字塔都是由玻璃甚至水晶類物質構成的，其表面相當光滑，沒有裂縫或不完整的地方，就連海藻，海草，貝殼等附著物也沒有。要知道在海里建造工程非常困難，所以金字塔以及別的古建築物應該都是在陸地上就已經建好。因為地震或者地殼運動等下陷沉入了海底，這一點也和亞特蘭蒂斯的歷史對上了。
無獨有偶，人們在距離臺灣宜蘭60海里的與那國島南面海地同樣發現了諸多海底金字塔以及古神殿的遺蹟。其中有各種不同的時期建築，柱穴，人頭雕像，拱門及幾何圖形的海龜等。除此之外，還有一些類似於迴廊城牆的建築物，最後甚至發現了雕刻在石牆上的象形文字。根據專家們的研究得出，這裡的海底文明存在大概有1.2萬年了。兩年前海底考古調查隊將海底神殿以電腦合成的方式繪製成立體圖，並依據建築物的方位判斷，該遺蹟可能是古代居民聚會祭拜的神廟。此外，神殿殿東方的拱形城門，巨石疊成的城門等與在1萬年後才興起的琉球王國建築類似。
除此之外，人們還在城門附近發現了兩塊重疊巨石。有人推測這應該是城門下方的基石，是為了避免城門倒塌而建造。除了神殿的種種發現外，位於與那國島東南海岸的立神巖最近也有驚人的發現，立神巖自古以來就是島上居民的祭拜物件。因為當地一隻廣泛流傳著這麼一個傳說，在古時候，有一位青年坐在立神巖上，突然海上風浪洶湧而來。當人即將被沒入海中時，青年開始在巖上閉目虔誠祈禱，他睜開眼睛時發覺自己竟然坐在陸地上安全的地方。因此立神巖成為島上的守護象徵，附近的海域因此也成為神靈出沒的神聖海域。
巧的是在2011年，琉球大學海底調查隊於立神巖正下方發現了高達數米的人頭雕像，以及有明顯人工雕琢痕跡的石砌。上面同樣具備象形文字。這項新的發現不但與美國學者詹姆斯柴吉伍德提出的亞特蘭蒂斯大陸不謀而合。而且也證明了當地傳說所暗示的萬年前地層下陷的事實，根據瑪雅曆法的預言傳說，地球人類所生存的世界共有五次毀滅和重生週期，每一週期即所謂的太陽季。並認為在每一季結束時都會演繹出驚心動魄的毀滅悲劇，而這些文明就是因此而毀滅。