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提到單細胞測序,相信各位小夥伴們都很熟悉,真是又愛又恨的一個技術啊,愛它既能幫助我們解決很多科研問題,同時也是對它的價格暗暗咬牙;大家莫慌,今天小編就給大家一個神器——單細胞混樣測序,讓大家用小經費就能輕輕鬆鬆發表5分左右的文章。

單細胞Mix(混樣)測序產品是基於10x Genomics和BD Rhapsody平臺,利用寡核苷酸偶聯的抗體孵育不同的樣本,為不同的樣本標記上不同的標籤,然後將多個樣本混合在一起,按照單一樣本文庫製備的流程,進行一次建庫操作,然後上機測序,實現多樣本混樣單細胞測序。

單細胞Mix測序實驗流程圖

研究目的:利用單細胞RNA測序(scRNA- seq)研究原發性人類股骨頭組織細胞(FHTCs)組成的初步特徵,以及它們之間在單細胞水平上的複雜串聯;

樣本資訊:4個原發性人類股骨頭組織細胞(FHTCs);

測序策略:10x平臺,單細胞測序(scRNA-seq);

捕獲細胞數:26574個原代人股骨頭組織細胞;

結論:發現絲氨酸蛋白酶23(PRSS23)和基質重塑相關蛋白8(MXRA8)是新的骨代謝相關基因;單核細胞、T細胞和B細胞的幾個亞型與骨代謝有關。

文章流程圖

總 結

4個樣本——scRNA-seq——常規單細胞測序生信分析 。

研究目的:利用單細胞RNA測序(scRNA- seq)來揭示人類指甲的細胞圖譜;

樣本資訊:多指症患者的4個多餘指甲樣本,指甲基質和指甲單元的部分富集單細胞;

測序策略:10x平臺,單細胞測序(scRNA-seq)

捕獲細胞數:11,541個細胞;

結論:單細胞RNAseq顯示了指甲特異性間質和上皮細胞群,分別以RSPO4(先天性無睪症的主要基因)和SPINK6為特徵。

總 結

4個樣本——scRNA-seq——常規單細胞測序生信分析——簡單免疫組化驗證。

研究目的:利用單細胞RNA測序(scRNA- seq)構建一個細胞圖譜,全面描述慢性血栓栓塞性肺動脈高壓(CTEPH)患者的肺動脈內膜切除組織的細胞組合特徵;

樣本資訊:5個肺動脈內膜切除的組織;

測序策略:10x平臺,單細胞測序(scRNA-seq)

捕獲細胞數:27,140細胞;

結論:發現了17個細胞簇的特徵,對應10,518個標記基因,然後分為8種細胞型別,包括成纖維細胞/平滑肌細胞、內皮細胞、T細胞/NK細胞、巨噬細胞、肥大細胞、富含半胱氨酸分泌蛋白LCCL域的2(CRISPLD2)+細胞、癌症幹細胞。

總 結

5個樣本——scRNA-seq——常規單細胞測序生信分析。

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不知道大家有沒有發現,要利用單細胞測序發表一篇5分左右的文章還是非常容易的,小編經過的文獻調研發現,基本上只需要以下幾個步驟:找準一個研究方向——收集4-6個樣本——scRNA-seq——常規的單細胞測序生信——簡單QPCR/WB/IF/IHC驗證(甚至都不用驗證),一篇3-5分的單細胞測序文章get到了!

神器來啦——單細胞Mix(混樣)測序,看了前面的流程圖有些小夥伴可能發現了,多個樣本混樣以後只進行一次建庫,單細胞測序裡面什麼最貴,當然是建庫試劑盒了,這下好了,最貴的那部分成本大大的縮減了,每個小夥伴都可以做單細胞測序了!!!!

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吉凱基因憑藉多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累,建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺,為中國研究型醫生提供科研服務,加快科研成果轉化,其中,單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq,單細胞核測序,單細胞混樣RNA-seq、單細胞ATAC-seq,單細胞(RNA+ATAC),空間轉錄組測序等服務。

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