北京時間12月16日晚，2019-2020賽季歐聯杯32強淘汰賽對陣抽籤儀式在瑞士尼翁的歐足聯總部進行。

與歐冠抽籤相同，歐聯杯採取種子隊對陣非種子隊的規則。同小組的球隊迴避，同足協的球隊迴避，此外烏克蘭的球隊與俄羅斯的球隊迴避。

歐聯杯32強：

12個小組第一：凱爾特人、塞維利亞、馬爾默、西班牙人、巴塞爾、林茨、阿森納、波爾圖、根特、伊斯坦布林、布拉加、曼聯。12個小組第二：希臘人競技、哥本哈根、赫塔費、葡萄牙體育、克盧日、法蘭克福、盧多戈雷茨、流浪者、沃爾夫斯堡、羅馬、狼隊、阿爾克馬爾。8個歐冠小組第三：布魯日、奧林匹亞科斯、頓涅茨克礦工、勒沃庫森、薩爾茨堡紅牛、國際米蘭、本菲卡、阿賈克斯。

最終的抽籤對陣如下：狼隊VS西班牙人葡萄牙體育VS伊斯坦布林赫塔菲VS阿賈克斯勒沃庫森VS波爾圖哥本哈根VS凱爾特人希臘人競技VS巴塞爾克魯日VS塞維利亞奧林匹亞科斯VS阿森納阿爾克馬爾VS林茨布魯日VS曼聯盧多戈雷茨VS國際米蘭法蘭克福VS薩爾茨堡頓涅茨克礦工VS本菲卡沃爾夫斯堡VS馬爾默羅馬VS根特格拉斯流浪者VS布拉加