一個完善的管理制度或管理方案對財稅代理企業來說是必不可少的。但是有些小微財稅代理企業，特別是剛接觸財務行業或初創階段的財稅企業老闆，因為覺得自己的公司需要一份制度，就會去照抄其他財稅企業制度或者模式，這種情況會使公司的管理制度失去了存在的意義，形同虛設。每家企業的人員配置和軟硬件條件都不一樣，這樣就會導致制度沒有一點實際執行的意義。

企業不同，相應的管理制度也應該不同。財務企業管理制度需要根據自己公司的企業性質、工作性質、員工類別等來定製。比如：會計、稅政、維護的職能劃分，有的企業是細分到各個不同部門來行使職權，有的企業則是一個部門統轄所有業務，這就要求企業根據自身實際情況而制定不同的管理制度。

因為企業制度是企業本身及其構成機構的行為準則，是企業員工的行為規範，是企業高效發展的活力源泉。所以財稅企業在制定制度前，必須是在充分了解政策和市場方面的相關問題後，結合公司自身情況，制定出適合自己的管理制度。真正起到作用的制度，一定是結合企業的實際情況來制定的。企業的各項制度制定，不是用來給別人看的，而是要真正落到實處，這樣才能幫助企業真正發揮制度管理的作用。

關於財稅代理企業制度的制定，可以從部門職能的劃分上面來制定：

（1）業務部：拓展市場，挖掘和簽約代賬客戶，承接工商稅務業務；

（2）維護部：客戶關係維護、客戶資料交接：

（3）稅政部：處理客戶涉稅事務，含一般納稅人業務、友票業務等：

（4）會計部：做賬報稅，會計憑證製作與裝訂；

（5）工商部：處理工商事務，含註冊、變更、註銷、批文等。

大多數情況下，財務公司往往僅有業務部與會計部，業務部同時行使維護、稅政、工商部門的職權：公司內部財務、行政很多則由老闆本人負責。

總的來說，每一家財稅代理企業的管理制度都要有自己的個性，都必須結合企業自身實際情況，制定適合自己的制度，才能發揮其在公司經營管理和提高經濟效益中的作用。