隨著深度學習的蓬勃發展,越來越多的小夥伴開始嘗試搭建深層神經網路應用於工作場景中,認為只需要把資料放入模型中,調優模型引數就可以讓模型利用自身機制來選擇重要特徵,輸出較好的資料結果。
在現實工作場景中,受限制資料和時間,這樣的做法其實並不可取,一方面大量資料輸入將導致模型訓練週期增長,另一方面在當前細分市場中,並非所有場景都有海量資料,尋找海量資料中的重要特徵迫在眉睫。
本文我將教你三個選擇特徵的方法,這是任何想從事資料科學領域的都應該知道。本文的結構如下:
資料集載入和準備方法1:從係數獲取特徵重要性方法2:從樹模型獲取特徵重要性方法3:從 PCA 分數中獲取特徵重要性結論資料集載入和準備為了方便介紹,我這裡使用"load_breast_cancer"資料集,該資料內置於 Scikit-Learn 中。
以下程式碼段演示如何匯入庫和載入資料集:
import numpy as npimport pandas as pdfrom sklearn.datasets import load_breast_cancerimport matplotlib.pyplot as pltfrom matplotlib import rcParamsrcParams['figure.figsize'] = 14, 7rcParams['axes.spines.top'] = FalsercParams['axes.spines.right'] = False# Load datadata = load_breast_cancer()
呼叫以下程式碼,輸出結果。
df = pd.concat([pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names),pd.DataFrame(data.target, columns=['y'])], axis=1)df.head()
上述資料中有 30 個特徵變數和一個目標變數。所有值都是數值,並且沒有缺失的值。在解決縮放問題之前,還需要執行訓練、測試拆分。
from sklearn.preprocessing import StandardScalerfrom sklearn.model_selection import train_test_splitX = df.drop('y', axis=1)y = df['y']X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.25, random_state=42)ss = StandardScaler()X_train_scaled = ss.fit_transform(X_train)X_test_scaled = ss.transform(X_test)
方法1:從係數獲取特徵重要性檢查特徵重要性的最簡單方法是檢查模型的係數。例如,線性迴歸和邏輯迴歸都歸結為一個方程,其中將係數(重要性)分配給每個輸入值。
簡單地說,如果分配的係數是一個大(負或正)數字,它會對預測產生一些影響。相反,如果係數為零,則對預測沒有任何影響。
邏輯非常簡單,讓我們來測試一下,邏輯迴歸是一種合適的演算法。擬合模型後,係數將儲存在屬性中coef_。
from sklearn.linear_model import LogisticRegressionmodel = LogisticRegression()model.fit(X_train_scaled, y_train)importances = pd.DataFrame(data={ 'Attribute': X_train.columns, 'Importance': model.coef_[0]})importances = importances.sort_values(by='Importance', ascending=False)# 視覺化plt.bar(x=importances['Attribute'], height=importances['Importance'], color='#087E8B')plt.title('Feature importances obtained from coefficients', size=20)plt.xticks(rotation='vertical')plt.show()
下面是相應的視覺化效果:
該方法最大特點:簡單、高效。係數越大(在正方向和負方向),越影響預測效果。
方法2:從樹模型獲取重要性訓練任何樹模型後,你都可以訪問 feature_importances 屬性。這是獲取功特徵重要性的最快方法之一。
以下程式碼演示如何匯入模型並在訓練資料上擬合模型,以及重要性的獲取:
from xgboost import XGBClassifiermodel = XGBClassifier()model.fit(X_train_scaled, y_train)importances = pd.DataFrame(data={ 'Attribute': X_train.columns, 'Importance': model.feature_importances_})importances = importances.sort_values(by='Importance', ascending=False)# 視覺化plt.bar(x=importances['Attribute'], height=importances['Importance'], color='#087E8B')plt.title('Feature importances obtained from coefficients', size=20)plt.xticks(rotation='vertical')plt.show()
相應的視覺化效果如下所示:
方法3:從 PCA 分數獲取特徵重要性主成分分析(PCA)是一種出色的降維技術,也可用於確定特徵的重要性。
PCA 不會像前兩種技術那樣直接顯示最重要的功能。相反,它將返回 N 個主元件,其中 N 等於原始特徵的數量。
from sklearn.decomposition import PCApca = PCA().fit(X_train_scaled)# 視覺化plt.plot(pca.explained_variance_ratio_.cumsum(), lw=3, color='#087E8B')plt.title('Cumulative explained variance by number of principal components', size=20)plt.show()
但這是什麼意思呢?這意味著你可以使用前五個主要元件解釋源資料集中 90%的方差。同樣,如果你不知道這意味著什麼,繼續往下看。
loadings = pd.DataFrame( data=pca.components_.T * np.sqrt(pca.explained_variance_), columns=[f'PC{i}' for i in range(1, len(X_train.columns) + 1)], index=X_train.columns)loadings.head()
第一個主要組成部分至關重要。它只是一個要素,但它解釋了資料集中超過 60% 的方差。從上圖中可以看到,它與平均半徑特徵之間的相關係數接近 0.8,這被認為是強正相關。
讓我們視覺化所有輸入要素與第一個主元件之間的相關性。下面是整個程式碼段(包括視覺化):
pc1_loadings = loadings.sort_values(by='PC1', ascending=False)[['PC1']]pc1_loadings = pc1_loadings.reset_index()pc1_loadings.columns = ['Attribute', 'CorrelationWithPC1']plt.bar(x=pc1_loadings['Attribute'], height=pc1_loadings['CorrelationWithPC1'], color='#087E8B')plt.title('PCA loading scores (first principal component)', size=20)plt.xticks(rotation='vertical')plt.show()
這就是如何"破解"PCA,使用它作為特徵重要性的方法。