三方協議書和就業協議書都是屬於合同協議範疇的文件，但二者有著不同的特點。

三方協議書一般是由雇主、員工和勞動中介機構三個不同方面簽署，主要是為了明確雇主與勞動中介機構之間的關系，以及員工與雇主之間的職位、權限、工資、職責等方面的具體約定，此外還需要有勞動保障方面的條款約定。

就業協議書則是雇主和員工之間簽署的協議，主要是為了規定雙方的勞動關系，明確雙方在工作法律義務和權利。總之，二者的有區別，三方協議書包涵了更多的內容和參與方，而就業協議書更側重於明確雇主與員工之間的權利義務。

三方協議書和就業協議書都是用於明確相關責任和義務的法律文件。不同之處在於，三方協議書是指三方之間的協議，一般指甲方、乙方和丙方之間訂立的協議，需要三方共同簽署，並且三方都有相關的責任和義務。

而就業協議書則是指雇主和職工之間的協議，就業協議書是一種僱佣合同，規定了雙方在聘用和被聘用方面應遵守的條款和條件。

聯繫在於二者都是使用法律文件的形式，明確相關方之間的責任和義務。

二者區別是三方協議書是明確畢業生、用人單位、學校三方在畢業生就業工作中的權利和義務的書面表現形式，就業協議書是普通高等學校畢業生和用人單位在正式確立勞動人事關系前，經雙向選擇，在規定期限內確立就業關系、明確雙方權利和義務而達成的書面協議。

三方協議書是《普通高等學校畢業生、畢業研究生就業協議書》的簡稱，它是明確畢業生、用人單位、學校三方在畢業生就業工作中的權利和義務的書面表現形式，能解決應屆畢業生戶籍、檔案、保險、公積金等一系列相關問題。協議在畢業生到單位報到（憑《全國普通高等學校本專科畢業生就業報到證》或《全國畢業生研究生報到證》）、用人單位正式接收後自行終止。

就業協議書《全國普通高等學校畢業生就業協議書》的簡稱，是普通高等學校畢業生和用人單位在正式確立勞動人事關系前，經雙向選擇，在規定期限內確立就業關系、明確雙方權利和義務而達成的書面協議，是用人單位確認畢業生相關信息真實可靠以及接收畢業生的重要憑據，也是高校進行畢業生就業管理、編制就業方案以及畢業生辦理就業落戶手續等有關事項的重要依據。

三方協議書和就業協議書都是用於明確工作雙方之間的關系和責任的文件，但存在一定的區別。三方協議書一般是指用於明確合作雙方、項目內容和合作方式等的協議書，通常包括甲方、乙方和丙方，而就業協議書則是用於規定招聘公司與求職者之間的工作關系和條件的文件。

具體來說，三方協議書適用於商業合作或其他合作形式，而就業協議書則適用於勞動用工關系。