1.外觀不同：馬克筆頭和筆桿是扁平的方形，也由筆桿、筆芯和筆尖組成；水彩筆筆頭和筆桿是圓形的，由筆桿、筆芯和筆尖組成。

2、不同類型：馬克筆分為油性馬克筆和水性馬克筆。油性馬克筆多用於一次性快速繪圖，乾燥快，耐水，耐幹。雖然不能溶於水，但可溶於酒精，如果筆幹了，在筆芯中加入一些酒精，然後再用一段時間。水性馬克筆顏色鮮豔，可溶於水，乾燥後在筆芯中加入一些水也可以使用一段時間。水彩筆有單色水彩筆、雙色水彩筆和多色水彩筆。單色水彩筆只有顏色差異，有12色、24色、36色等色號。寫雙色水彩筆有兩種顏色。多色水彩筆是由多種顏色的筆芯組合而成，常用於美工作畫。

3.用途不同:水彩筆水分充足，色彩豐富明亮，但水分不均勻，過渡不自然，兩種顏色不容易混合在一起，一般適合兒童繪畫；馬克筆水分均勻，顏色對比較弱。兩種顏色可以很好的協調，可以畫建築效果圖、工業設計效果圖、POP廣告等。

4、價格不同：馬克筆的價格高於水彩筆。

馬克筆是一種使用水性顏料的筆，它可以創造出柔和、圓潤的筆觸，因此最適合繪畫或有質感需求的繪畫。

而水彩筆是一種專業繪畫性筆，它可以創造淡淡的、輕盈的水彩色彩和效果，但渲染速度較慢，適用於藝術家的作品創作，也可以用來做卡通繪製。

1.水彩筆筆頭一般是圓的，而馬克筆頭是扁的。

2.水彩筆一般是12色、24色、36色一盒裝賣，而馬克筆大部分可以散的賣。

3.馬克筆分水性和油性2種，而水彩筆只有1種水性。

4.水彩筆的優點是水分足，色彩豐富，鮮豔，缺點是水分不均勻，過渡不自然，兩色在一起不好調和，所以一般適合畫兒童畫；馬克筆的優點是水分均勻，色彩對比弱一些，2種色彩可以很好的協調，可以畫建築效果圖，工業設計效果圖，以及POP廣告等等。

1、外形：筆頭方面水彩筆筆頭一般是圓的，而馬克筆頭是扁的。

2、種類：馬克筆分水性和油性2種，油性馬克筆多用於一次性的快速繪圖，乾的很快，耐水、耐幹。水性馬克筆色彩明亮，能夠溶於水。而水彩筆只有水性1種，但是可以分為單色水彩筆、雙色水彩筆和多色水彩筆。

3、實用：馬克筆能疊色，而水彩筆不能疊色，馬克筆比水彩筆更容易上色。

4、價格：馬克筆的價格，往往要高於水彩筆的價格。