鄰近效應和定向排列及意義是在兩個以上底物參與的反應中，由於酶的作用，底物被聚集到酶分子表面，彼此相互靠近並形成正確的定向關系，大大提高了底物的局部濃度，底物被催化的部位定向地對準酶的活性中心，實際上是將分子間的反應變成類似於分子內的反應，從而大大提高催化效率。

鄰近效應(approximation effect)是指，酶由於具有與底物較高的親和力，從而使游離的底物集中於酶分子表面的活性中心區域，使活性中心區域的底物濃度得以極大的提高，並同時使反應基團之間互相靠近，增加自由碰撞機率，從而提高了反應速度。在生理條件下，底物濃度一般約為0.001 mol/L，而酶活性中心的底物濃度達100mol/L.

定向效應(orientation effect)是指，底物的反應基團與酶的催化基團之間，或底物的反應基團之間正確地取向所產生的效應。 鄰近反應基團之間能夠正確取向，分子間反應趨向於分子內反應，增加底物的激活，從而加速反應。

“鄰近”和“定向” 共同產生的催化效應。

底物變形和誘導契合

酶受底物誘導發生構象改變，特別是活性中心的功能基團發生的位移或改向，產生張力作用，促使底物形變，削弱有關的化學鍵，從而使底物從基態轉變成過渡態，有利於反應進行。

酸鹼催化

酸鹼催化是通過瞬時的向反應物提供質子或從反應物接受質子以穩定過渡態，加速反應的一類催化機制。

在水溶液中，通過水分子的高反應性的H+和OH-進行的催化稱為專一性酸鹼催化（specific acid-base catalysis)或狹義的酸鹼催化。

通過其它供體提供的H+和OH-進行的催化稱為總酸鹼催化或廣義酸鹼催化（generai acia-base catalysis)。酶之所以可以作為酸鹼催化劑，是由於很多酶活性中心存在酸性或鹼性氨基酸殘基，例如羧基、氨基、胍基、巰基、酚羥基和咪唑基等。它們在近中性pH範圍內，可作為催化性質的質子受體(OH-)或質子供體(H+)，有效地進行酸鹼催化。

像元臨近效應就是光學鄰近效應

光學鄰近效應 (Optical Proximity Effect, OPE)是由於部分相干成像過程中的非線性空間濾波，像強度頻譜的能量分布和位相分布相對理想像頻譜有一定畸變，並最終大大降低了成像質量，即引發光學鄰近效應。