巨頭蛋龜通常在4-8月生蛋，這是它的繁殖期，不過人工飼養的龜可能會有一定的差別。和其他的動物一樣，它也是有性成熟期的，一般5-7歲的龜才可以繁殖，如果是溫室飼養的龜，需要的時間可能會長一些，經過自然冬眠，可以促進性激素的釋放，從而縮短成熟的時間，可以更快進行繁殖。

1、繁殖週期：通常巨頭蛋龜5歲的時候就成熟，到了7歲可以進行交配繁殖，但還要看看它們的體重，一般公的要在150克左右，母的為250克。自然環境下，它們會從4月底開始產卵，一直到8月份，其中5-7月是高峰期，一年可以產卵3-4次，每次會隔10-25天左右，每次可以產5-8枚卵。

2、產卵過程：巨頭蛋龜在產卵前會選擇一個好的穴位，通常在土質疏鬆且可以預防敵害的樹根旁，然後就會開始挖穴，穴口在3-4厘米左右，深度有8-9厘米。挖好後，母龜就會將卵產在穴中，然後用土將其蓋上，整個過程大概需要8個小時。

3、幼龜出殼：巨頭蛋龜卵一般在產出的30天后會變成紫紅色，70天后變黑，質地堅硬，等到80-90天就會破殼。一般出殼後它們就能入水獨立生活。

龜蛋的孵化出苗時間與溫度有關，溫度高則出殼快，溫度低則出殼慢。

南石：50----82天

金錢龜：67----90天

三爪相龜：75----90天

麗箱龜：70天左右

黑頸龜：60----75天

草龜:58-----75天

麝香龜(蛋龜)：84天左右

紋面側頸：120天左右

黃緣：75----90天

四眼：135天左右

花龜：60天左右

豬鼻：60----70天

地圖：60----75天

紅肚短頸：42----49天

刺山龜：100多天

甜甜圈：90----100天

日本石龜：60----90天

小蟾頭龜：200天左右

枯葉龜：280天左右

佛羅里達為龜：70----100天

安哥洛卡：168----296天

鱷龜：55----125天

大鱷：100----140天

錦龜：70----80天

潘氏：60-----65天

地龜：兩個多月

緬甸星龜：100天左右

放射龜：145----231天

凹甲：75天左右

豹紋龜：130----150(有過392天的記錄)

蘇卡達：120天左右

四爪陸龜：60天左右

埃及陸龜：60----120天

緬陸：98----134天

鉸背(河葉)陸龜：5個月左右

餅乾龜：99----237天靴腳陸龜：不超過70天

緣翹陸龜：60----110天