一、對象不同： 會計監督的對象是資金流動，從其縱向即運動過程而言，包括事前監督(如預測和計劃)、事中監督(如日常控制)和事後監督(如檢查、審核)。它伴隨著經濟活動而進行，貫穿經濟活動的始終。 審計監督的對象是反映經濟過程、經濟現象的會計資料和其它經濟資料，重點審查這些資料是否真實、合法、有效。它以查賬為中心，對會計工作進行檢查。

二、方法不同： 會計監督是運用專門的方法，即對經濟業務進行計量、記錄、分類和匯總，通過填制憑證、登記賬薄和編制報表，從而形成會計資料即會計信息。這種會計信息可提供給有關人員進行管理和決策。 審計監督的方法是研究、分析、調查和評價，按照一定的程序，如出具審計通知書、製定審計工作方案、編寫審計工作底稿、撰寫審計報告等，通過審計，查明會計資料、其它經濟資料以及它們所反映的經濟活動是否真實正確，是否合理合法，是否經濟有效，並提出審計意見和結論。

三、職能作用不同： 會計監督是會計的基本職能之一，它是對資金運動進行的管理工作，其主要作用在於控制經濟活動，促進經濟發展，正確處理國家、集體和個人三方面的關系。通過對資金的會計監督，達到正確合理地組織、分配和使用資金，降低費用和成本，增加積累，不斷提高資金使用的經濟效益。 審計監督作為一項獨立的經濟監督活動，其主要作用在於通過對會計資料的檢查，監督財務收支，維護財經紀律，保護財產安全完整。它一般是通過檢查來確定會計資料的正確性、完整性和合法性，進而審查財務收支，檢查錯弊，堵塞漏洞，提高效益。