主要區別是科屬不同：第一，金槍魚是金槍魚科金槍魚屬動物；第二，而三文魚是鮭科鮭屬動物。

金槍魚體形較長，粗壯而圓，呈流線形，向後漸細尖而尾基細長，尾鰭為叉狀或新月形。尾柄兩側有明顯的稜脊，背、臀鰭後方各有一行小鰭。具有魚雷體形，其橫斷面略呈圓形。金槍魚的形狀也很奇特，它的整個呈流線型，順著頭部延伸的胸甲，仿佛是一塊獨特的能夠調整水流的平衡板。

金槍魚和三文魚是兩個不同的魚類品種。金槍魚一般是指金槍魚族，是硬骨魚綱、鯖形目、鯖科下的一類魚苗，是一種海水魚。

而三文魚是鮭形目、鮭屬的一種魚類，是一種淡水魚。

金槍魚和三文魚的肉質口感也不同，金槍魚的肉質柔嫩鮮美,蛋白質含量高,但脂肪含量很低，三文魚的肉質較肥，口感潤滑，入口即化。

金槍魚和三文魚的區別還是很大的，金槍魚屬於海水魚，別名吞拿魚，目前沒有人工養殖，三文魚是一種淡水魚，營養價值約等於金槍魚高。員工養殖非常普遍。金槍魚和三文魚屬於不同科屬。他們屬於的動物類別不同。

其次，金槍魚與三文魚產地不同。金槍魚分布印度洋，太平洋中部與大西洋中部等地。而三文魚主要分布在太平洋北部及歐洲，亞洲，美洲的北部地區。

第三，金槍魚和三文魚的形態有區別。金槍魚體態較長，粗壯而圓，呈流線型。三文魚體型偏扁，背部隆起。齒尖銳，銀灰色。

最後他們功效有區別。金槍魚性平。歸肝腎經，具有強化肝腎的功能。有益於心腦血管疾病。三文魚性溫，歸胃經，具有補虛勞，健脾胃，暖胃和中的功效。