生鮮牛乳從被擠出來到送往生產車間，已經做到了幾乎不與空氣接觸，減少了原奶被汙染的機會。在轉盤擠奶車間，60多頭奶牛經過自動引導系統有序走上擠奶轉盤，操作工人安裝好吸奶器，全自動擠奶系統便開始運作。擠出的原奶經過密閉管道，會直接進入早已等候在外的恆溫4攝氏度全封閉儲奶罐中，再由運奶車運到生產工廠。在運輸過程中，伊利對每一滴牛奶都實現了可視化GPS跟蹤，入廠後採用條碼掃描，隨機編號檢測。

　　從牧場送到工廠的原奶，還不能立即投入生產。還必須接受伊利多達117項指標的檢測，只有全部合格，才會進入生產程序。牛奶的預處理也叫 “標準化處理”，整個過程要經過9道工序，包含牛奶採樣檢測、計量、過濾、分離、均質、兩次殺菌等，每一道工序都對牛奶的品質起著至關重要的作用。

伊利還設立了食品質量安全“三條線”，為伊利牛奶品質嚴格把關。即在國標線的基礎上，提昇50%的標準制定企標線;在企標線的基礎上，又提昇了20%的標準，製定了內控線。“三條線”層層加碼，進一步提昇了企業自身食品安全的風險管控能力。

　　在灌裝車間，伊利牛奶盒的頂部採用超聲波封口技術，通過超聲波技術直接對包材中的塑料夾層進行熱熔粘接，不使用任何膠水和粘合劑，確保牛奶品質不會受到任何汙染。

從無菌灌裝、無菌處理到包裝出庫的整個生產過程中，牛奶全部在密閉管道中，確保伊利牛奶的質量安全。每一滴伊利牛奶從誕生到走上餐桌，都需要經過層層嚴格把關，只為帶給消費者安全、

牛奶殺菌常用的有兩種方法，一種是巴氏殺菌法，一種是超高溫滅菌法。

使用巴氏殺菌法的牛奶，處理溫度較低，經過殺菌後，牛奶中還會保留少量耐熱的細菌和細菌芽孢，因此不耐儲存。一般保質期較短的牛奶，如保質期45天以內的牛奶，大多使用巴氏殺菌法。這類牛奶生產出來後，需要放在冷藏的環境中儲存。