馬克筆一般分油性和水性兩種。

前者的顏料可用甲苯稀釋，有較強的滲透力，尤其適合在描圖紙(硫酸紙)上作圖；後者的顏料可溶於水，通常用於在較緊密的卡紙或銅版紙上作畫。在室內透視圖的繪製中，油性的馬克筆使用得更為普遍。水性的特點是色彩鮮亮且筆觸界線明晰；和水彩筆結和用又有淡彩的效果。缺點是重疊筆觸會造成畫面髒亂，洇紙…… 油性的特點是色彩柔和筆觸優雅自然，加之淡化筆的處理，效果很到位。缺點是難以駕馭，需多畫才行。水性馬克筆雖然比油性馬克筆的色彩飽和度要差，但不同顏色上的疊加效果非常好。在墨線稿上反復平鋪，墨水泛上來與水性馬克筆的顏色相混合，形成很漂亮的中間灰色。重的陰影是用油性馬克筆壓上。故水性馬克筆有機質基本色就可以了。馬克筆快速表現技法是一種既清潔且快速，有效的表現手段。說它清潔是因為它在使用時候快乾，顏色純和不膩。由於其筆號的多而全（強調的一點是馬克筆因品牌的不同筆號亦不同）。在使用時候不必頻繁的調色，因而非常的快速。馬克筆用的是否出色，很大程度上取決於速寫的功底。馬克筆也好，彩色鉛筆也好，在使用時需要有很強的自信。這樣才會有很到位的筆觸。力度和瀟灑是馬克筆效果圖 懂得魅力所在。

1、意思不一樣

馬克筆漫畫版：指畫漫畫上色用的筆。

馬克筆標準版：批用來畫建築設計等的筆。

2、色彩不一樣

馬克筆漫畫版：色彩飽滿，色度偏豔麗。

馬克筆標準版：色彩均勻，環境色較多。

3、筆頭不一樣

馬克筆漫畫版：筆頭較纖維、筆頭更寬，筆觸柔和。

馬克筆標準版：筆頭的筆觸硬朗。

4、質感不一樣

馬克筆漫畫版：有顆粒狀的質感。

馬克筆標準版：可畫出變化不大，較粗的線條質感。

5、用途不一樣

馬克筆漫畫版：多用於動漫、服裝等。

馬克筆標準版：多用於建築、室內、工業設計、產品設計的手繪中。