最佳藥是利克多黴素因為針對灰黴病是一種非常常見和難以治愈的病，利克多黴素是一種廣譜抗生素，可以針對多種微生物並有很高的殺菌能力，故是最佳藥物
預防灰黴病還要從日常的防範入手，比如減少澆水量、保持通風、減少植物之間的接觸等等，防止病毒的擴散

1、嘧黴胺：該藥物具有一定的保護與治療雙重作用，主要是通過抑制病菌侵染酶的分泌從而有效阻止病菌侵染，最後將病菌消滅。對灰黴病特效，現在已經產生抗性，容易產生藥害的作物有：豆類、大棚櫻桃以及茄子等敏感作物。

2、腐黴利：該藥低溫高溼條件較好，內吸性也比較好，具有一定的保護與治療的作用，主要抑制菌體內甘油三酯的合成。

3、乙黴威藥：主要通過和菌體細胞內的微管蛋白質相結合，影響細胞的分裂，和多菌靈產生交互抗性，通常不會作單劑使用。

4、菌核淨：防治灰黴病效果好，持效期比較長，有一定的內滲作用，防治茄子黃瓜3000倍以上，其他1200倍以上即可。

5、異菌脲：屬於一種廣譜觸殺、保護性殺菌劑，主要抑制病菌孢子萌發與菌絲生長，同時對於核盤屬、小菌核屬、叢梗孢屬、葡萄孢屬以及鏈孢黴屬具有較好的殺菌功效。

6、啶酰菌胺：主要抑制孢子的萌發，和其他殺菌劑無交互抗性，持效期比較長，如發生灰黴病需復配其他治療鏟除性的嘧黴胺等一起使用。

7、氟唑菌胺：SDH抑制劑，目前還沒使用過，應具體一定的保護作用，對於防治灰黴病有特效。

防治灰黴病的最佳農藥有嘧黴胺、腐黴利、多菌靈、乙黴威、異菌脲、菌核淨、咯菌腈、多抗黴素等農藥。

其中嘧黴胺為新型殺菌劑,屬苯胺基嘧啶類其作用機理獨特,對常用的非苯胺基嘧啶類殺菌劑已產生抗藥性的灰黴病菌有效。