細菌鞭毛直徑只有10～30nm,遠低於光學顯微鏡的分辨率.用普通的結晶紫番紅等方法染色,在顯微鏡下也是看不到的.其實結晶紫可以用作鞭毛染色,不過方法和普通的不一樣,會在鞭毛周圍沉澱,使鞭毛變粗.

鹼性復紅法和副品紅法：1926年由Gray首創，Leifson於1930年建立了副品紅法，並於1938年和1951年兩次對該方法進行了改良，稱為Leifson方法。

結晶紫法：

又稱Ryu法，1937年由Ryu建立，1982年由Kodaka等進行了改良。

鞭毛染色原理

鞭毛是細菌的運動“器官”，在普通光學顯微鏡的分辨力限度以外，故需要用特殊的鞭毛染色法，才能看到。在顯微鏡下觀察細菌的運動性，也可以初步判斷細菌是否有鞭毛。通常使用壓滴法或懸滴法觀察細菌的運動性。觀察時，要適當減弱光線，增加反差，如果光線很強，細菌和周圍的液體就難以辨別。

鞭毛染色是借媒染劑和染色劑的沉澱作用，染色前先用媒染劑(如單寧酸或明礬鉀)處理，讓它沉積在鞭毛上，使鞭毛直徑加粗，然後再進行染色（如鹼性復紅、硝酸銀、結晶紫）。

常用的媒染劑由丹寧酸和氯化高鐵或鉀明礬等配製而成。目前，細菌鞭毛染色方法根據染色劑的不同，可分為鹼性復紅法、副品紅法、結晶紫法、維多利亞藍B法、鍍銀染色法和熒光蛋白染色法6類，前5類方法的媒染劑成分中均含有單寧酸。