1、土黴素消毒法 將種蛋放入預先配好的土黴素鹽酸鹽水溶液中浸泡15分鐘。藥液濃度為0.05%（即1公斤水中放0.5克土黴素鹽酸鹽），溶液的溫度為4℃。如溫度高時，可將冰塊放入溶液內降溫至4℃後，再將種蛋放入浸泡，15分鐘後取出在孵化室內放置1～2分鐘，當種蛋表面不太溼時，放回孵化機內繼續孵化。這種方法對支原體的消毒效果顯著。

2、福爾馬林（甲醛溶液）消毒法 用福爾馬林與高錳酸鉀混合燻蒸消毒種蛋和孵化機。每立方米用5克高錳酸鉀和30毫升福爾馬林。這種燻蒸消毒法，可以同時消毒種蛋和孵化機。

3、高錳酸鉀（灰錳氧）消毒法 高錳酸鉀為黑紫色結晶，有金屬光澤，易溶於水。消毒種蛋時用0.5%的高錳酸鉀溶液浸泡種蛋1分鐘，取出瀝乾後裝盤即可。

種蛋可以通過以下方式進行消毒：1.使用1%至2%的石灰水或0.1%的高錳酸鉀溶液浸泡半小時，可有效消除表面細菌和病毒。
2.採用紫外線消毒，將種蛋放在紫外線照射箱中進行紫外線消毒處理，用適當時間可有效滅活細菌和病毒。
3.過氧化氫消毒方法，使用過氧化氫溶液對種蛋進行消毒，能夠有效去除細菌和病毒。
總之，對於種蛋的消毒方法，需要根據實際情況選擇適當的方法，確保種蛋的質量和安全性。

1.

紫外線照射消毒 一般要求紫外線的光源距種蛋0.4米,照射1分鐘後,把種蛋翻過來再照射一次,最好多用幾個紫外線燈,從各個角度同時照射,效果更好。

2.

漂白粉液消毒 將種蛋浸入含有活性氯1.5%的漂白粉液中3分鐘,取出瀝乾後即可裝箱。使用此法,必須在通風處進行。

3.

過氧乙酸燻蒸消毒 按每立方米用過氧乙酸溶液50毫升、高錳酸鉀5克燻蒸15分鐘,可快速有效殺死大部分病原體。當然大型種雞場還可用洗蛋消毒液進行消毒。

鴨蛋產出後容易被糞便、墊料汙染，蛋殼表面便帶有病原微生物，這些病原微生物繁殖速度很快，據測定，新生蛋的蛋殼表面細菌數為100～300個，15分鐘後為500～600個，1小時後達到4000～5000個。

病原微生物通過蛋殼、殼膜上的氣孔進入蛋的內部，感染發育中的胚胎，或在雛鴨出殼時進入雛鴨體內，從而使雛鴨發病。種蛋受到汙染不僅影響孵化率，而且還可能汙染孵化機和用具，傳染各種疾病。因此，應注意墊料的清潔衛生，及時收集種蛋，不要用水洗蛋，更不要用刷子洗刷蛋殼，否則會除去對病原微生物有一定阻礙作用的殼膠膜。蛋產出後，應立即進行消毒處理，殺滅蛋殼表面粘附著的病原微生物。常用的消毒方法有以下幾種： （1）福爾馬林（甲醛）燻蒸消毒法 需用一個密封良好的消毒櫃，40%的甲醛溶液、高錳酸鉀，由於上述消毒藥具有強烈的腐蝕性，應用陶瓷或玻璃容器盛裝。將種蛋置於消毒櫃內，按每立方米空間用40%的甲醛溶液30毫升，高錳酸鉀15克倒入容器中，應先放高錳酸鉀，然後再倒甲醛溶液，關閉門窗燻蒸消毒20～30分鐘，然後打開門窗，儘快將氣體排除。消毒時最適環境溫度為25～27℃，相對溼度為75%～80%。這種方法消毒效果好，殺菌能力強，可殺死蛋殼表面的細菌、芽胞和病毒，在孵化生產中廣泛使用。由於上述藥物具有腐蝕性，消毒時產生的氣體具有刺激性，使用時應注意防護，避免與人的皮膚接觸或吸入。（2）新潔爾滅消毒法 取5%的新潔爾滅原液加50倍水配成0.1%的溶液，用噴霧器噴灑於蛋的表面，待藥液乾燥後即可送入蛋庫或入孵。使用新潔爾滅溶液時，切忌與肥皂、碘、高錳酸鉀和鹼等配用，以免藥液失效。（3）百毒殺噴霧消毒法 百毒殺是含有溴離子的雙鏈四級胺化合物，沒有腐蝕性和毒性，對細菌、黴菌等均有消毒作用，可用50%的百毒殺3毫升加10升水配成消毒液對種蛋進行噴霧消毒。百毒殺價格便宜，使用安全、簡便。

消毒種蛋常用的消毒劑有高錳酸鉀、福爾馬林、過氧乙酸、次氯酸鈉等。用高錳酸鉀和福爾馬林燻蒸消毒是目前國內常用的方法，操作方便，滅菌殺毒效果顯著。

種蛋收集後，立即裝盤上架，在專用的熏蒸室內，按每立方米容積加福爾馬林42毫升、高錳酸鉀21克的比例，將福爾馬林倒入盛有高錳酸鉀乾粉的容器中，燻蒸30分鐘。燻蒸時關嚴門窗，保持溫度24℃以上，溼度75%以上，燻後排出氣體。為了防止種蛋在保存期間又被汙染，在入孵升溫前可用同法再消毒一次，消毒劑用量減少1/3。