一般來說，海關會將查獲的動植物等送交相關部門進行鑒定和處理，這些部門可能包括林業、漁業、農業、動植物檢疫等部門。

如果查獲的物種屬於瀕危或受保護的物種，可能會按照相關法律規定進行沒收和處罰。如果沒有違法問題，可能會被退回給持有者或者銷毀。

對罰沒的野生植物活體，會在專門的種植棚內種植養護。對於案件中查獲的各種野生動物活體，按照野生動物收容救護相關管理規定，救治成功的個體在案件結束後在其適應的環境進行放歸，不適宜放歸的個體調配到就近的救助中心進行救護。

海關在查獲非法入境的活體時，一般生物是會焚燒處理；有毒的活體是需要完善的無害化統一處理。一有可疑警報，就會觸動大量警員。

走私國家禁止進出口的珍貴動物及其製品的,處五年以上十年以下有期徒刑,並處罰金;

情節特別嚴重的,處十年以上有期徒刑或者無期徒刑,並處沒收財產;

情節較輕的,處五年以下有期徒刑,並處罰金。