中國科大擁有數學、物理、化學、地球物理學、生物學、科學技術史、力學、核科學與技術等8個一級國家重點學科。理學門類以及國家重點學科6個，列全國高校首位；理學博士點的國家重點學科覆蓋率達100%。

1、出國最好的：物理化學系（大部分出國） 物理系 化學系（基本出國） 生命科學學院（只有出國這一條路） 地球物理（教授比學生多） 工程和信息學院總體出國率不是太高 但也有個別系很高端的（安全工程、核工程、力學基地班、23系）

2、就業最好的：信息學院,信息工程、通信工程據說是最好的.然後是自動化，計算機。

但是，中國科大提倡的是精品教學，不存在哪個專業好的問題，而只關心對哪個專業感興趣。因為所有專業都有自己的優勢，不是出國好，就是就業好，或者考研好。而且，在大二的時候有全校性轉專業，大三能在學院內換專業，大四能換專業方向。基本上大家都能去自己想去的專業。所以最重要的是能考上中國科大