首先是績效考核模式。外科醫生是以崗位係數為基礎的RBRVS（以資源為基礎的相對價值比率）為標準進行考核；內科則引入DRGs，根據疾病嚴重程度，對醫生工作量進行考核。

其次，分配方式上，從院科兩級分配到醫院直接核發到個人（85%的績效由醫院根據醫生的工作考核直接發到個人，15%由科室進行統籌）。

華西醫院的醫師績效分配和考核自成一體，形成了既能體現醫務人員崗位價值和勞動價值，也兼具激勵和引領作用的體系。

同樣，在護理人員績效考核方面，華西醫院也是不斷創新，其績效評價建立在以護理單元為主體的績效考核機制基礎上，之後可根據實際工作量的變化進行適當的調整，各護理單元根據勞動負荷高低分為特級、甲、乙、丙、丁、戊6個類別，分別賦予不同的係數標準，然後通過下列公式得出個人基本係數作為薪酬分配的依據：基本係數=護理單元工作負荷等級係數×護理專業崗位層級係數×管理崗位係數。

護理職系薪酬管理規範了考核關鍵指標和評估標準，在護理人員的層面實現了同工同酬的量化公平分配，並能在一定程度上提昇了團隊凝聚力。