1、通過儘快摘除植株上的帶蟲果，收集地上掉落的果進行深埋或者火燒，消滅果實蠅的卵或者幼蟲，以此減少果實蠅的基數。同時，給果樹修剪過密的枝條，使得果樹通風透氣，光照充足，也可以減少果實蠅的發生。

2、果實套袋：在果實生長中後期，採取果實套袋，可有效減少果實蠅等多種病蟲害的發生，適用於越冬果以及柚類，對於沃柑、砂糖橘等品種不太適用。

1、進行果實套袋，可以有效防止桔小實蠅產卵危害。

2、在果園裡每畝可掛5~10個誘捕器誘殺田間桔小實蠅的雄成蟲，筒內誘劑每隔15天應添加80%敵敵畏乳油原油一次，長期堅持可以取得明顯的效果。

3、在桔小實蠅羽化盛期和產卵前期，採用80%敵百蟲1000倍液，或1.8%愛福丁3000倍液噴霧,每週1次,連噴3~5次。

4、採用清園、浸水和切斷寄主鏈等農業措施可有效降低田間的蟲口密度。在果實成熟期間,每隔3～5天收集田間爛果或落果進行集中漚浸，可消滅果中的幼蟲，大大減低蟲源。果園內及附近忌種番茄、辣椒等瓜果類寄主作物，對切斷該蟲食物鏈具有重要作用.採用與非寄主植物的間種、淺翻挖土、冬季灌水2～3次等措施更能破壞越冬幼蟲、蛹、成蟲生境,可促進該蟲的大量死亡。