1. 生物質轉化：生物反應器中的微生物可以利用有機物質和無機物質進行代謝和生長，這些有機物質和無機物質通常都是通過加入營養液等方式提供給反應器的。

2. 氣液傳質：生物反應器中需要提供氧氣和二氧化碳等氣體，這些氣體通過反應器中的氣體傳輸系統被輸送到反應器中。同時，反應器中還需要進行氣液傳質，將反應器中產生的氣體排出。

3. 溫度、pH值、壓力等控制：生物反應器中的微生物對溫度、pH值、壓力等條件都有一定的要求，因此反應器需要通過控制系統來控制這些參數，以維持微生物的生長和代謝。

4. 生物反應器的結構：生物反應器通常由反應器本體、控制系統、氣體傳輸系統、營養液供給系統等組成。反應器本體包括反應器的容器、攪拌器、溫度和pH傳感器等，用於維持反應器中的環境參數。

生物反應器的原理是應用重組DNA技術和轉基因技術,將目標基因轉移到尚未分化的動物胚胎細胞(或受精卵)中,經胚胎移植,得到能在乳腺中表達轉基因產品的個體,其乳腺組織可分泌生產“目的產品”,如具有藥用價值的蛋白。

這些蛋白進入奶中,再通過回收含轉基因蛋白的動物奶,就可以提取有重要藥用價值的生物活性蛋白。