1. 時間衝突：據傳黃子韜是因為檔期衝突而退出了《萌探探探案》第三季的錄製。目前他活躍度很高，擔任了不少節目和電影的演出和主持工作，因此檔期上的問題不排除。

2. 聚焦音樂事業：黃子韜是一位歌手兼演員，音樂事業一直是他的重心之一。在2018年底，他成立了自己的音樂制作工作室，並且近年來連續發行了多張個人音樂專輯。因此也有網友猜測他退出《萌探探探案》可能是為了放更多時間在音樂創作上。

3. 前期的負面影響：在節目第一期播出後，有網友指出黃子韜在現場表現出現了一些小失誤和不專業的行為，因此有的網友猜測制作方為了讓他暫時退出，進行一些修整和調整。總之，黃子韜為何退出《萌探探探案》第三季，原因眾說紛紜，但官方並沒有做出明確的回應說明。無論原因如何，他在節目中的表現還是得到了相當多的觀眾喜愛，也為這檔探案綜藝節目帶來了不少流量。

因為黃子韜參加了綜藝節目《青春有你3》的錄製，需要抽出時間進行訓練和拍攝，所以《萌探探探案》的錄製暫停了兩期。
不過黃子韜的這些綜藝活動也向粉絲展示了他多才多藝的一面，對於他的藝能發展也很有幫助。