在 iPad 上套上保護殼並關上屏幕時，通常並不會直接導致設置關閉。保護殼主要是用來保護設備的外觀和屏幕的安全，而不會對設備的設置產生影響。

然而，如果您的 iPad 配備了智能保護殼或 magnet（磁鐵）功能，當您關閉保護殼或翻蓋時，它可能會觸發設備的自動休眠功能。這意味著當您關閉保護殼或翻蓋時，屏幕可能會自動關閉，並將設備置於睡眠狀態，以節省電池電量。

如果您遇到保護殼關閉屏幕後無法喚醒設備或設置發生變化的問題，有幾種可能的原因：

1. 保護殼故障：某些保護殼設計可能存在缺陷或故障，導致關閉屏幕後無法正常喚醒設備或觸發誤操作。您可以嘗試更換另一個保護殼，或者暫時不使用保護殼，觀察問題是否解決。

2. 設置調整：有些保護殼可能需要進行特定的設置調整才能與設備正常配合使用。請查閱保護殼的說明書或聯繫廠商以獲取更多信息。

3. 軟件問題：有時，設備的操作系統可能會出現異常或錯誤，導致保護殼與屏幕關閉行為產生衝突。您可以嘗試重新啟動設備或進行系統更新，以解決可能的軟件問題。

如果以上解決方法無效，建議您諮詢蘋果官方支持或前往授權的蘋果零售店進行更進一步的故障排除和解決方案。