系統方面來說6S和6SP上搭載的iOS 9。最為重要的是iOS 9對3D Touch進行了適配，讓觸摸體驗不僅限於UI平面。而iPhone6 Plus搭載iOS 8系統。雖然的界面風格上與iOS7區別不大，但iOS8系統更加開放與人性化。在鎖屏狀態下送短消息時，支持在鎖屏狀態下直接回復短信。另外在多任務欄，也可直接顯示最近的聯繫人名片，並支持自定義編輯。可以直接給他們發郵件、打電話等，大大增強了iOS的效率。
攝像頭作為iPhone6s硬件升級的一個重點，與前幾代祖傳的800萬像素攝像頭不同的是，iPhone6s搭載了一枚1200萬像素攝像頭，有力提高了相機的解析力，而像素經過重新構建，像素點之間的干擾信號更少(像是三星的ISOCELL技術)，更高效地利用光，讓畫面的噪點更低，色彩更通透。而iPhone6 Plus採用了一顆800萬像素的攝像頭，每個像素大小1.5微米，最大光圈f/2.2，並採用全新傳感器，保留了雙色溫閃光燈之外還內置了全新的對焦技術。iPhone6 Plus加入了光學防抖功能，使防抖能力以及弱光拍攝表現得到很大提昇。
所以喜歡小屏手機的可以選擇6S喜歡大屏手機的可以選著6SP。
系統方面來說6S和6SP上搭載的iOS 9。最為重要的是iOS 9對3D Touch進行了適配，讓觸摸體驗不僅限於UI平面。而iPhone6 Plus搭載iOS 8系統。雖然的界面風格上與iOS7區別不大，但iOS8系統更加開放與人性化。在鎖屏狀態下送短消息時，支持在鎖屏狀態下直接回復短信。另外在多任務欄，也可直接顯示最近的聯繫人名片，並支持自定義編輯。可以直接給他們發郵件、打電話等，大大增強了iOS的效率。
攝像頭作為iPhone6s硬件升級的一個重點，與前幾代祖傳的800萬像素攝像頭不同的是，iPhone6s搭載了一枚1200萬像素攝像頭，有力提高了相機的解析力，而像素經過重新構建，像素點之間的干擾信號更少(像是三星的ISOCELL技術)，更高效地利用光，讓畫面的噪點更低，色彩更通透。而iPhone6 Plus採用了一顆800萬像素的攝像頭，每個像素大小1.5微米，最大光圈f/2.2，並採用全新傳感器，保留了雙色溫閃光燈之外還內置了全新的對焦技術。iPhone6 Plus加入了光學防抖功能，使防抖能力以及弱光拍攝表現得到很大提昇。
所以喜歡小屏手機的可以選擇6S喜歡大屏手機的可以選著6SP。