為保障野生動物的正常生活、遷徙和繁衍,青藏鐵路全線建立了33個野生動物通道。2002年夏季,國家珍稀野生動物藏羚羊產仔遷徙時，相關施工單位主動停工為它們讓道。野生動物通道的建設,充分考慮了沿線野生動物的生活習性、遷徙規律等,以保障野生動物的正常生活、遷徙和繁殖。

中國青藏鐵路建設了羌塘動物通道，可可西里動物通道，通天河動物通道，青藏鐵路是連接青海和西藏拉薩的一條大動脈，這條鐵路全長上萬公里，穿過了整個青藏高原，設計的時候考慮到對野生動物的影響，因此，修建了許多動物通道。

2004年6月中旬，青藏鐵路專門設計的 33處野生動物通道全部建成。6月22日，首批300多隻藏羚羊通過野生動物通道實現了自由遷徙。

在青藏鐵路設計時，為了不影響野生動物的生活和遷徙，對於穿越可可西里、羌塘等自然保護區的鐵路線，盡可能採取了繞避的方案。同時，根據沿線野生動物的生活習性、遷徙規律等，在相應的地段設置了野生動物通道，以保障野生動物的正常生活、遷徙和繁衍。野生動物通道設計時不僅吸納了野生動物專家、環保部門的建議，還徵求了當地牧民的意見。

青藏鐵路唐古拉山北段和南段分別設置了野生動物通道25處和8處，通道有橋梁下方、隧道上方及緩坡平交3種形式。其中橋梁下方通道13處、緩坡平交通道7處、橋梁緩坡複合通道10處、橋梁隧道複合通道3處。對於高山山地動物群，主要採取隧道上方通過的通道形式；對於高寒草原草甸動物群，主要採取從橋梁下方和路基緩坡通過的通道形式。（鐵道部提供）

目前，在青藏鐵路沿線，已經設計了野生動物通道33處，通道總長達58．47公里，佔線路總長度的5．27％。在西藏，在經過牧場附近的鐵路還設立了200多個家畜通道，以適應犛牛、驢、羊等的通過，這些家畜通道同時也基本能滿足野生動物通過的需要。