北京現代ix35一共使用了三種變速箱，分別是7速雙離合變速箱、6速手動變速箱、6速手自一體變速箱。雙離合變速箱和手自一體變速箱都是比較常見的自動變速箱。

雙離合變速箱的結構與手動變速箱差不多，這種變速箱其實是基於手動變速箱研發的。現代ix35車型搭載的是第二代6速手自一體的變速箱，是現代集團自己旗下的派沃泰變速箱。發動機和變速箱的匹配完善度非常高。派沃泰也是除了採埃孚和愛信外，第三個有能力生產成熟8AT的變速箱公司，所以其實力可見一斑。在升降檔方面都非常積極，而且平順性不錯，頓挫感基本感覺不到。

雙離合變速箱相對於傳統的手動變速箱來說，換擋時間更短，動力傳遞損失更低。在新一代的雙離合變速箱中，解決了以前雙離合變速箱過熱而導致容易換擋失誤的問題，耐熱性加強了。而且雙離合變速箱比較輕，可以減輕發動機艙內的重量，提供更好的駕駛操作性。速度提昇得快，動力傳遞損失小。