北京航空航天大學和南京大學的計算機專業旗鼓相當，專業等級評估都是A，研究生培養的質量沒有明顯的高低之分，但從專業細分來看，南京大學強項在於軟件工程這一塊，近年來還專門成立了人工智能研究院，北航軟件和硬件研究實力則更均衡一些。

北航的計算機專業

北航：北航的專長有計算機，電子信息，航空和航天以及兩航的周邊專業。工科實力十分強勁，京城公認的工科第二。但是建校時間短，歷史積澱淺，校園文化單一，對於學生的人格養成起到了很不好的反作用。算是一種畸形教育。不過學風很好。而且在航空航天業內具有舉足輕重的作用。

北航的計算機專業比較好，其實南大和北航的計算機專業都是比較好的，只是個人感覺北航的計算機專業好一些，師資力量雄厚，學生的成績比較好，就業情況很好。

南京大學，南大隻要有的工科，都是國內一流。更何況是計算機，是國家重點學科，國家重點實驗室。