1、滅菌效果不同。

在同樣的溫度下，溼熱的殺菌效果比干熱好。其原因為：

一、蛋白質凝固所需的溫度與其含水量有關，含水量愈大，發生凝固所需的溫度愈低。溼熱滅菌的菌體蛋白質吸收水分，因較大同一溫度的乾熱空氣中易於凝固。

二、溫熱滅菌過程中蒸氣放出大量潛熱，加速提高溼度。因而溼熱滅菌比干熱所要溫度低，如在同一溫度下，則溼熱滅菌所需時間比干熱短。

2、滅菌溫度和時間不同。

乾熱滅菌比溼熱滅菌需要更高的溫度與較長的時間。 

乾熱滅菌利用幹烤箱，加熱160～180℃保持2小時，可殺死一切微生物，包括芽胞菌。主要用於玻璃器皿、瓷器等的滅菌。而溼熱滅菌只需煮沸100℃，5分鐘，能殺死一般細菌的繁殖體。許多芽胞需經煮潮5～6小時才死亡。

3、滅菌介質不同。

滅菌介質不一樣，乾熱是熱的空氣，而溼熱是水蒸汽。時間不一樣，乾熱是30分鐘，1小時，2小時。溼熱整個過程只有1小時不到。