建築、能環、信息、土木、電子、自動化、生醫、電氣、交通、儀器科學 建築系是本科、研究生均在，其他的只有研究生在。

四牌樓以工科研究生為主，基本沒有文科類研究生。 東南大學（Southeast University），簡稱東大，坐落於南京市，是中央直管、教育部直屬的副部級全國重點大學，中國著名的建築老八校之一，國家“211工程”、“985工程”首批重點建設的大學，是“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越醫生教育培養計劃”、“2011計劃”、“111計劃”入選高校，“卓越大學聯盟”、“中俄工科大學聯盟”、“中歐工程教育平台”主要成員。

建築學院（建築研究所）、能源與環境學院、信息科學與工程學院、土木工程學院、電子科學與工程學院、自動化學院、生物科學與工程學院（學習科學中心）、電氣工程學院、交通學院、儀器科學與工程學院、集成電路學院這幾個院的碩士、博士都在四牌樓校區，學院也是。