要在WPS輸出PDF中設置目錄導航，您可以按照以下步驟進行操作：

1. 打開WPS文檔，確保文檔中有需要放入目錄的章節標題和小節標題。

2. 在菜單欄中選擇“插入”，然後選擇“目錄和索引”。

3. 在目錄和索引對話框中，勾選“顯示在文檔底部”。

4. 在“項目級別”中，使用數字來選擇章節和小節在目錄中的層級，數字越小，層級越高。

5. 在“摘要文本”中，輸入章節和小節的標題，確保它們與文檔中的標題完全一致。

6. 點擊“確定”按鈕，WPS會自動將所選文本轉換為目錄。

7. 在輸出PDF時，勾選“創建PDF書籤”選項即可創建目錄導航。

8. 保存PDF文件，然後在閱讀器中打開，您將看到PDF文檔中的目錄導航。

需要注意的是，目錄導航不一定能在所有的PDF閱讀器中正常顯示，具體情況取決於閱讀器功能的支持情況。