孔雀魚的繁殖方式如下，雄性孔雀魚的臀鰭進化為授精器，通過授精器和雌魚進行交配，受精卵在雌魚的腹內進行孵化，卵化時間滿足後以仔魚的形式生出。這種繁殖方式被稱為"卵胎生"。

胎生和卵生的最大不同在於，胎生的動物是通過臍帶從母親那直接獲得養分，但是卵胎生的幼體則是在母親體內，通過吸收自已卵黃部分的養分發育的。而稱為卵胎生的方式，表面上看起來類似胎生，但實際上是在母親體內由卵孵化而來。

孔雀魚在出生4-6個月之後就進入繁殖的適齡期。其實開始繁踵的時間還可以提前一些，所以從出生後就需要把雌性和雄性分開飼養。否則，仔魚在出生兩個月後就有可能會生出自己的下一代。通常產仔時間大約在將雌魚和雄魚(之前沒有交尾經驗)放在一起飼養的一個月之後，但是一些變種或自子個體則需要更長一段時間。另外，一次交尾後，雌魚會有兩次或三次產仔，而自子個體多會在第二次產仔時由無精卵發育而來。