主要有以下三種區別：

1. 兩種膜供水的用途不一樣；

反滲透膜主要用於家庭飲用水，隨著反滲透技術的不斷改進，反滲透的供水已能滿足整個廚房用水的水量了。而超濾膜供水則只能適合家用、洗滌用。　　

2.兩種膜的標準不一樣；　　

反滲透膜標準更高。超濾膜合格標準為了每毫升水100個菌落，而RO反滲透膜則為每毫升水20個菌落。可以說RO反滲透膜標準高於超濾膜四倍。　

3.兩種膜的孔徑相差較大；

RO反滲透膜的孔徑僅為超濾膜孔徑的1/100，所以反滲透膜可以去除水中的極小的有機分子汙染，比如化學有機物、有機農藥汙染等。而超濾膜則不能。反滲透膜還有軟化水質的作用，將硬水轉為軟水。

超濾膜也有它的優點，超濾膜不用接電，這樣就沒有用電安全問題，而且接頭小、簡單，出故障與漏水的機率較低。成本低，價格便宜。屬於經濟型的過濾膜。所以超濾淨水器比RO反滲透淨水器也便宜很多。