阿笠博士曾經在無意中透露出與灰原父親一直很熟，那就不難讓人推測出，他們二人說不定曾經共事的事實！

事情是這樣的，工藤優作原先就懷疑並且偵察黑衣組織。以小說家的身份為掩護，秘密調查。發現一些線索後特意搬到黑衣組織首腦阿笠家的隔壁住，並且從小培養新一 ，並派新一和阿笠混熟想借此偵察一些情報。當阿笠開始懷疑工藤父子的時候，想出一條毒計，他派GIN和沃克跟蹤出去約會的小蘭和新一，大家都看過第一集，其實交易是幌子，真正的目的是跟蹤，於是新一也就被他們變成了柯南。之後，阿笠順理成章地成為了新一的同伴與監護人，並且柯南實際上成了阿笠手中的人質，當時新一的父母第一次出現的那一集，實際是和阿笠談判的，最終的結果是阿笠以 柯南要挾他們兩個人流放到瑞士。而優作因為不能和新一說明真相，從而讓新一感到受騙，受到傷害。只能同意阿笠的要求，不再回日本 ，所以你們看優作只有103集的時候回過日本，還是變裝的，不能讓阿笠發現。

其實APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母聯合開發的，而成功後哀的父母意外身亡。阿笠留著柯南不死只不過想觀察藥品還有沒有其他的副作用。但是突然有一天，優作和有紀子突然潛回日本，和柯南（103-104集）秘密接觸，讓他感受到了威脅，於是安排一個間諜時刻跟隨在柯南的身邊，那就是灰原哀。哀其實是APTX-4689的第一個實驗品，本來藥的目的是永葆青春，沒想到竟然適得其反產生副作用，造成了身體變小。而柯南事件發生後，哀就成了在柯南身邊臥底的最好人選。為什麼柯南從來沒有被騷擾過就是因 為柯南其實一直在黑衣組織最厲害的老大的監視下。毛利小五郎也是因為追查阿笠才從警界退出的，當時槍擊非英里事件只是藉口，所以 後來暮木說毛利總是把他們引向歧途。

青山剛昌已經給大家提示了，不過因為太晦澀所以沒幾個人看得出來。其實阿笠這兩個字，如果拆解成阿竹立用日文反過來拼寫就是拉丁 文裡面的莫里亞帝。所以阿笠博士其實應該叫莫里亞帝教授——福爾摩斯里的罪惡的教授。

首先阿笠博士已經被73老師否定了，我想73不會做那種自打嘴巴的事。然後，誰是黑暗首腦其實不重要，只希望紅黑最終碰撞時，主要人物別死掉。最後，由衷希望在有生之年柯南能完結，不留遺憾。

暮目警官是老大

1當時灰原去取磁帶時不在其管理區域，暮目卻快速趕到，而且那磁帶作證以日本法律作證後必須在二十個工作日歸還，要麼灰原、博士瞞著柯南，要麼警官有問題。

2每個常出場人物都有自己的番外一篇，就暮目沒有。

這個Boss，首先來說，最不可能是柯南身邊的人，因為黑衣人組織很重視這種毒藥的研究，所以出了事一定會告訴Boss，所以這個Boss一定知道這種藥會給部分人帶來特別的效果，因此，如果這個Boss是柯南身邊的人，就一定會發現柯南的特別之處，聯想到藥的問題，一定會暗中觀察柯南，但是，柯南九百多集都沒被發現，足以證明這個Boss不是柯南身邊的人，我們自然無跡可尋。

不過嘛，說到黑衣人組織，就不得不提一些關於這個神秘組織的細節。

一：代表該組織的顏色是黑色。

二：該組織極有可能分為幾大黨派。

三：該組織做事很乾淨，幾乎不會留下痕跡。

四：該組織勢力非常龐大，擁有多處房產和工廠。

五：或許該組織建立的初衷是造福人類……

六：該組織的保密工作做得非常好，而且只有組織高層可以知道組織首領的個人資訊。

原因：黑羽盜一以怪盜基德的形象出現時穿的是黑色的衣服，大家都知道，黑衣人組織的人行動一般都會穿黑色的衣服。另外，關於黑羽盜一的眾多情節有矛盾，而唯一能解釋這些的就是：他是黑衣人組織的老大。

目暮警官是最後老大 幾乎每集都出現 目的觀察柯南的一舉一動 每次出現都是正面人物 越是不像的越有可疑 柯南的一貫作風

有可能是灰原哀，其實她才是黑手組織幕後首腦，因發現工藤新一併沒有死，而是變小了之後，於是潛伏到工藤身邊，然後一直在觀察工藤時也在組織間傳密。但是卻不曾想，竟對工藤懂了真情，於是後來一直幫助工藤，組織知道了，就想要把灰原殺死，因為雖然她是首腦，但是組織不能因為她而毀。於是黑手組織對抗工藤新一，灰原選擇了放棄黑手組織幕後首腦的身份，幫助工藤。

以狗血作家的思維，我認為最終boss是工藤新一的老爸跟老媽.

1.虎父無犬子，自己的兒子被黑暗組織這樣糟蹋，作為老爸老媽不會有查出真兇的衝動？（ps：據說柯南老爸也是一名名偵探）

2.以柯南的偵查能力，能與之抗衡的只有他身邊熟悉他動向的人，小蘭、毛利跟博士顯然跟boss沒半點關係（無需質疑，別說什麼毛利在裝，他日常作風就斷定了這個人粗心大意，真是毛利的話這片子完全沒有觀賞價值）.

暫時只想到這麼多，想到後再補充

目前 青山說了阿笠博士不是boss 柯南變回新一 拆了一對情侶 赤井秀一 貝爾摩德死了 灰原可能也要死 最後boss可能是被聚集的名偵探 黃金城堡那集裡背景介紹的那個人

在下一部劇場版會說boss是日本天皇，灰原也會為了柯南死去，小蘭為了愛情吃下變小藥。下一個劇場版會在今年10上映，叫(什麼黑)(我忘記了)

我個人覺得 有3個可能性 1.即使有人闢謠 但我還是覺得 阿笠博士 極有可能是最後boss 目前有4人吃過APTX4869 苦艾酒 外圍妹妹 柯南 灰原哀 但只有苦艾酒一人成功 柯南 和 灰原哀吃完後 都變小了 而且灰原哀還是參與制作這個藥的工程師 恰巧這兩個人都在阿笠博士家 你說阿笠博士和黑暗組織沒關係 誰信啊 2.黑羽 黑衣人裡也有會偽裝的 所以 黑羽也有可能性 但我認為可能行很小 3.其實我們都忽略了一個人 或 一個家族 那就是 鈴木園子 鈴木家族那麼有錢 那麼有實力 也許 Boos 就是鈴木家族的人 因為作者說過 boss是之前出現過的人物 所以 我更懷疑 阿笠博士和鈴木家族 醫藥技術可以讓壽命延長 金錢與權力 可以滿足人的內心慾望 如果把他倆聯絡在一起那是什麼 永恆的權利……當然 還有一個我最不想看到的可能性 那就是 以上幾百上千集的動畫片 都是柯南的一個夢 就跟哆啦A夢的結局似的 ……

目前為止，作者承認不是最終BOSS的人物有：少年偵探團（5人，算上小哀和柯南）、阿笠博士、工藤優作、阿笠定子（博士的姑姑，有在漫畫中提到）、三水吉右衛門、芙莎繪·坎貝爾·木之下、妃英理、毛利蘭、白鳥任三郎、詹姆斯·布萊克、鈴木園子、工藤新一、青山剛昌。更詳細的可搜尋百度百科詞條《那位先生》，裡面有詞條維護者根據官方訊息寫入的內容。

很多人都猜測是阿笠博士，但作者已經出面否認過了，作者原本的計劃中確實是阿笠博士，但他已經改變計劃。個人覺得目暮警官這人有問題，就算不是真正的boss，也很有可能是黑衣人組織裡面的一個重要人物。

不會是毛利小五郎吧。小五郎我覺得他總是在裝傻 其實自己是很有實力的我也覺得小五郎早就發現了柯南是新一的事情

一樓這些說阿笠博士是 那位先生 的人你們SB嗎，作者青山剛昌已經發表過宣告，不是阿笠博士，你們不知道看看啊？

首先，我必須承認，我也不知道 那位先生 是誰，但是，我在這裡重新回覆下各位，那位先生的判定條件：

1.那位先生不是阿笠博士

2.那位先生很喜歡酒

3.那位先生是目前已經出場過的人物

由此推斷，應該是漫畫或者動畫裡出現過的，喜歡酒，且年齡在三十到五十歲的男子，應該還很有錢。

可惜我沒時間去好好重新看一遍柯南，但是，我們可以從以上條件中，從動畫裡慢慢排除，就知道 那位先生 是誰了

我覺得那個大老闆應該是黑羽盜一，因為那個大老闆的郵箱地址的按鍵音是七隻烏鴉，烏鴉的羽毛是黑色的，所以就是黑羽。記的有一集安室透對貝爾摩德說過如果他們知道你是老闆的什麼。然後貝爾摩德就拿槍指著安室。說如果不想你的腦漿賤這輛車的前擋風玻璃。安室又說我死了，我的人就會在組組織裡散佈這個訊息。既然貝爾摩德和有希子是同門師姐妹，她們的師傅是黑羽盜一。為什麼貝爾摩德惠那個變聲術有希子卻不會。

我覺的應該是高木吧，因為他因為他在憾動警市廳1200萬人質那集中，曾經懷疑過柯南，並問柯南：＂你究竟是誰＂但之後便脫囗不題這件事，青山岡昌在接受採訪時不是說過嗎？最後的結果會讓人大吃一驚，他還說過這個人經常出現在柯南身邊。

首先boss不是阿笠博士，這個作者已經親口否認了，第二，作者證實過boss不是魔術快斗的人物，而且後期會大大降低怪盜基德參與主線劇情的戲份，所以猜黑羽盜一的基本也能否定了。第三，作者說過boss是以前曾經出現過的人物。第四，boss喜歡酒，非常聰明，對警方的一系列行動基本瞭如指掌有所準備，年齡基本肯定大於45歲，因為貝爾摩德是boss寵愛的物件，貝姐則很可能是超過40歲的老女人，現在只是變年輕了，貝姐可是早年跟黑羽盜一成為朋友的人。綜上所述，我猜測boss是FBI的那個老頭

我第一個懷疑的是阿笠博士，一開始，作者的想法是啊笠博士是boss，但作者又打消了這個念頭，啊！悲劇啊……

於是我想是黑羽快鬥，但他已經知道柯南是工藤新一了（說了就跟沒說一樣……）我就看看他的番外，其實他的目的是找到潘多拉（就是在月光下有粉色月牙的寶石……）so他也不是

真相只有一個……我知道了，就是青山剛昌（作者……）哈哈我太有才了！

我雖然不知道是誰，但是按正常文學作品寫作思路來說應該就是這些常出現的人中的某一個或者幾個，我覺得對於文學作品最重要的設計點就是巧合性，作為一個連載十幾年動漫畫，現在已經九百多話，就算最多能連載到1200話（這是我猜測的極限長度），boss現在連背影也沒出現過，也就是他需要至多300話去完成boss的人設，我覺得這在劇情上就有些倉促（boss剛出場殺了幾個人就被抓了，交代後續瑣碎，漫畫完結），所以他不可能去抓一個從未塑造過的路人去當最終boss。而且像這種偵探類文學作品的話，真正的壞人往往都是在前半段藉著好人的外皮，看起來實在幫主角，實際上劇情反轉後讀者才恍然大悟原來是在幫自己的套路屢見不鮮。所以說我咬定是身邊人

應該是衝野洋子，她是一個小人物，卻經常出現，而且每次身邊出現一些案件都找毛利小五郎，而且當時毛利小五郎還不是很有名氣，高興的是，她身邊居然經常死人，由此可見73安排她出場絕非巧合​