如題主所說，確實有很多王朝的第二位皇帝都是透過非法手段取得皇位的。其中比較有名的是唐、宋、明三個朝代。

公元626年，李世民在玄武門發動兵變，殺死太子哥哥李建成，弟弟李元吉，娶了弟媳婦，囚禁老父，從而獲得了皇位。這絕對算是非法取得皇位的人了。值得一提的是，李世民對這段歷史沒有遮掩(估計也這掩不住)，大概是鞭策自己一定要幹出一番成就吧。

趙光義入宮和哥哥趙匡胤在密室中飲酒，第二天清晨，趙匡胤忽然駕崩。趙光義就繼位成為了宋朝的第二任皇帝。因為燭影斧聲的說法一直都有，傳弟不傳子的做法也實在說不過去。很多人都認為宋朝開國皇帝趙匡胤的死和弟弟趙光義脫不了干係。如果這樣說的話趙光義也算是非法取得皇位了。

其實明成祖朱棣一直認為自己是第二任皇帝的，他認為自己的侄子朱允炆算不得皇帝。朱棣發動靖難之役，最終奪得了皇位。

我們分析這幾個朝代，就能發現其中的問題，為什麼很多開國皇帝的太子無法正常繼位？

1、建國初期國家時局不穩。

剛剛立國，民眾對國家的認可和歸屬感不強，很多有功的開國功臣對太子也缺乏尊重。這些因素使得開國皇帝的太子之位不那麼穩固。

2、軍權旁落

上文列舉的三個人，無一例外，手中都掌握著軍權。這是因為在創立國家之初，開國皇帝出於掌控全國的目的，會讓自己的血脈至親在外掌控軍權。開國皇帝在世時還好（也不好，李世民就軟禁了父親），一旦皇帝去世，這些人就成為了繼任者的巨大威脅。

3、經驗問題

這個說起來可能有點扯，但確實如此。開國皇帝的皇位是自己打拼來的，沒有繼承皇位的經驗。他們往往認識不到權力的交接對於一個王朝有多麼重要。體驗到了至高無上的權力的開國皇帝們往往不願意放權，這讓太子得不到任何鍛鍊。甚至有些皇帝會防範太子，這就讓太子的地位更加尷尬。這也讓有些人得到了可乘之機。

其實太子一直是危險係數賊高的職業，作為替補皇帝，一人之下，萬萬人之上。但是這個“替補”可不好當。要扛過去父親的猜忌，兄弟們的攻訐，大臣們的考驗，還得能熬過身體賊好的父親，才能最終坐上皇帝的寶座。

拋開那些正常死亡的不談，其實大多數開國皇帝的太子還是能正常繼位的。西漢、三國的曹魏、蜀漢、西晉、東晉、元等第一任皇太子都得以正常繼位。

可能很多人認為秦朝的第一任太子是扶蘇，其實歷史上秦始皇並沒有立太子，同時也沒有立皇后，也就是說扶蘇只能稱之為長子，並不能稱為嫡長子，因而秦朝也就不存在開國皇帝的太子都無法正常繼位的情況。

東漢的第一位太子是劉彊，其母為劉秀的第一任皇后郭聖通，劉秀立郭聖通為後只是因為政局需要，他心中真正的皇后實際是原配陰麗華，等到時局穩定後，劉秀也便將她所廢，不過並沒有罷黜劉彊，但劉彊審時度勢，多次辭讓，後劉秀改任陰麗華之子劉莊為太子。

孫吳的首任太子是孫登，不過早逝，後第二任太子孫和及魯王孫霸捲入奪嫡之爭，都沒落下好下場，孫吳皇位的第二任繼位者是第三任太子孫和。

隋唐兩代的第一位太子這個就不必多說了，相信大家應該都比較熟悉，一位是楊勇，一位是李建成，這兩位都是在奪嫡之爭中失敗還無緣於皇位的。

北宋開國皇帝趙匡胤並沒有立太子，他的繼任者是其第趙光義，南宋的趙構無子嗣，是在民間找了位趙匡胤的後代作為繼任者的。

明朝的首位太子朱標早逝，不過皇位的繼任者是他的兒子朱允炆。清朝的開國皇帝努爾哈赤並沒有立繼承人。

因而綜上所述，拋開第一任太子早逝的，實際上就只有東漢，隋唐三朝的第一任太子沒能正常繼任皇位。東漢是因為劉彊自行請廢，而隋唐是因為奪嫡之爭的失敗，這主要是因為兩位奪嫡之爭的勝利者楊廣，李世民功勳卓著，然後還有野心，而兩位落敗者並不是二位的對手。